Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB3P05106 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms