Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYBBP04839 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYBBP04839 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYBBP04839 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CYBBP04839 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYBBP04839 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYBBP04839 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYBBP04839 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYBBP04839 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYBBP04839 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CYBBP04839 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYBBP04839 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYBBP04839 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYBBP04839 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYBBP04839 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYBBP04839 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYBBP04839 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYBBP04839 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYBBP04839 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYBBP04839 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYBBP04839 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYBBP04839 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYBBP04839 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CYBBP04839 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CYBBP04839 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYBBP04839 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYBBP04839 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYBBP04839 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYBBP04839 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYBBP04839 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYBBP04839 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CYBBP04839 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CYBBP04839 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CYBBP04839 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CYBBP04839 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CYBBP04839 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
CYBBP04839 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
CYBBP04839 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CYBBP04839 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CYBBP04839 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CYBBP04839 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYBBP04839 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYBBP04839 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYBBP04839 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYBBP04839 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYBBP04839 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYBBP04839 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYBBP04839 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYBBP04839 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYBBP04839 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYBBP04839 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYBBP04839 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYBBP04839 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYBBP04839 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYBBP04839 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYBBP04839 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYBBP04839 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYBBP04839 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYBBP04839 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYBBP04839 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYBBP04839 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYBBP04839 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYBBP04839 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYBBP04839 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYBBP04839 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYBBP04839 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CYBBP04839 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYBBP04839 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYBBP04839 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYBBP04839 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYBBP04839 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYBBP04839 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYBBP04839 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYBBP04839 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYBBP04839 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYBBP04839 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYBBP04839 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CYBBP04839 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYBBP04839 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYBBP04839 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYBBP04839 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYBBP04839 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYBBP04839 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYBBP04839 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYBBP04839 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYBBP04839 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYBBP04839 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYBBP04839 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CYBBP04839 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CYBBP04839 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYBBP04839 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYBBP04839 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYBBP04839 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYBBP04839 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYBBP04839 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYBBP04839 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYBBP04839 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYBBP04839 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYBBP04839 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYBBP04839 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms