Protein–RNA interactions for Protein: P02774

GC, Vitamin D-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCP02774 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCP02774 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCP02774 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCP02774 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCP02774 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCP02774 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCP02774 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCP02774 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCP02774 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCP02774 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCP02774 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GCP02774 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCP02774 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCP02774 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCP02774 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCP02774 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCP02774 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCP02774 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCP02774 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCP02774 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GCP02774 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCP02774 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCP02774 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCP02774 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCP02774 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GCP02774 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCP02774 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCP02774 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCP02774 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCP02774 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCP02774 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCP02774 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCP02774 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCP02774 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCP02774 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCP02774 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCP02774 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCP02774 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCP02774 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GCP02774 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCP02774 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCP02774 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCP02774 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCP02774 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GCP02774 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCP02774 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCP02774 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCP02774 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCP02774 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCP02774 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCP02774 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCP02774 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCP02774 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCP02774 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCP02774 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GCP02774 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCP02774 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCP02774 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCP02774 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCP02774 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCP02774 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GCP02774 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCP02774 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GCP02774 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCP02774 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCP02774 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GCP02774 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCP02774 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCP02774 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCP02774 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCP02774 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCP02774 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCP02774 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCP02774 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCP02774 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCP02774 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCP02774 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GCP02774 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCP02774 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCP02774 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCP02774 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCP02774 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCP02774 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCP02774 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCP02774 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCP02774 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCP02774 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCP02774 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GCP02774 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCP02774 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCP02774 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCP02774 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCP02774 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCP02774 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GCP02774 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCP02774 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCP02774 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCP02774 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCP02774 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCP02774 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms