Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms