Protein–RNA interactions for Protein: O94953

KDM4B, Lysine-specific demethylase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 1,096 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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KDM4BO94953 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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KDM4BO94953 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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KDM4BO94953 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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KDM4BO94953 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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KDM4BO94953 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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KDM4BO94953 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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KDM4BO94953 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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KDM4BO94953 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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