Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRMUO75648 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRMUO75648 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRMUO75648 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRMUO75648 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRMUO75648 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRMUO75648 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRMUO75648 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRMUO75648 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRMUO75648 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRMUO75648 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRMUO75648 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRMUO75648 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRMUO75648 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRMUO75648 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRMUO75648 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRMUO75648 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRMUO75648 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRMUO75648 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRMUO75648 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRMUO75648 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TRMUO75648 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRMUO75648 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRMUO75648 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRMUO75648 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRMUO75648 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRMUO75648 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TRMUO75648 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRMUO75648 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRMUO75648 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRMUO75648 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRMUO75648 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRMUO75648 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRMUO75648 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRMUO75648 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRMUO75648 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRMUO75648 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRMUO75648 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRMUO75648 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRMUO75648 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRMUO75648 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRMUO75648 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRMUO75648 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRMUO75648 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRMUO75648 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRMUO75648 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRMUO75648 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRMUO75648 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRMUO75648 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRMUO75648 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRMUO75648 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRMUO75648 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRMUO75648 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRMUO75648 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRMUO75648 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRMUO75648 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRMUO75648 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRMUO75648 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRMUO75648 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRMUO75648 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRMUO75648 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TRMUO75648 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRMUO75648 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRMUO75648 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRMUO75648 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TRMUO75648 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRMUO75648 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRMUO75648 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRMUO75648 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRMUO75648 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRMUO75648 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRMUO75648 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRMUO75648 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRMUO75648 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
TRMUO75648 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRMUO75648 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRMUO75648 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRMUO75648 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRMUO75648 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRMUO75648 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRMUO75648 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRMUO75648 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRMUO75648 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRMUO75648 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRMUO75648 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRMUO75648 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRMUO75648 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRMUO75648 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRMUO75648 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRMUO75648 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRMUO75648 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRMUO75648 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRMUO75648 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRMUO75648 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRMUO75648 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TRMUO75648 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TRMUO75648 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TRMUO75648 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRMUO75648 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRMUO75648 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms