Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
ABCC9O60706 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
ABCC9O60706 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
ABCC9O60706 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
ABCC9O60706 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
ABCC9O60706 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
ABCC9O60706 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
ABCC9O60706 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
ABCC9O60706 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
ABCC9O60706 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
ABCC9O60706 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
ABCC9O60706 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
ABCC9O60706 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC33.61■■■□□ 2.97
ABCC9O60706 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
ABCC9O60706 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
ABCC9O60706 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
ABCC9O60706 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
ABCC9O60706 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
ABCC9O60706 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
ABCC9O60706 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
ABCC9O60706 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
ABCC9O60706 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
ABCC9O60706 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
ABCC9O60706 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC33.6■■■□□ 2.97
ABCC9O60706 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
ABCC9O60706 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC33.6■■■□□ 2.97
ABCC9O60706 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
ABCC9O60706 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
ABCC9O60706 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
ABCC9O60706 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
ABCC9O60706 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
ABCC9O60706 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
ABCC9O60706 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
ABCC9O60706 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
ABCC9O60706 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
ABCC9O60706 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
ABCC9O60706 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
ABCC9O60706 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
ABCC9O60706 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
ABCC9O60706 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
ABCC9O60706 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
ABCC9O60706 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
ABCC9O60706 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
ABCC9O60706 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
ABCC9O60706 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
ABCC9O60706 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
ABCC9O60706 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
ABCC9O60706 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
ABCC9O60706 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
ABCC9O60706 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
ABCC9O60706 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.58■■■□□ 2.97
ABCC9O60706 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
ABCC9O60706 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
ABCC9O60706 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
ABCC9O60706 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
ABCC9O60706 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
ABCC9O60706 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
ABCC9O60706 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
ABCC9O60706 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
ABCC9O60706 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
ABCC9O60706 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
ABCC9O60706 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
ABCC9O60706 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
ABCC9O60706 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
ABCC9O60706 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
ABCC9O60706 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
ABCC9O60706 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.97
ABCC9O60706 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
ABCC9O60706 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
ABCC9O60706 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
ABCC9O60706 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
ABCC9O60706 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
ABCC9O60706 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
ABCC9O60706 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
ABCC9O60706 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
ABCC9O60706 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
ABCC9O60706 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
ABCC9O60706 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
ABCC9O60706 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
ABCC9O60706 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
ABCC9O60706 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
ABCC9O60706 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
ABCC9O60706 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
ABCC9O60706 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
ABCC9O60706 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
ABCC9O60706 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
ABCC9O60706 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
ABCC9O60706 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
ABCC9O60706 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
ABCC9O60706 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
ABCC9O60706 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
ABCC9O60706 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
ABCC9O60706 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
ABCC9O60706 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
ABCC9O60706 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
ABCC9O60706 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC33.54■■■□□ 2.96
ABCC9O60706 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
ABCC9O60706 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
ABCC9O60706 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
ABCC9O60706 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms