Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB3O43889 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB3O43889 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB3O43889 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB3O43889 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB3O43889 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB3O43889 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB3O43889 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB3O43889 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CREB3O43889 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CREB3O43889 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CREB3O43889 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CREB3O43889 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CREB3O43889 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CREB3O43889 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CREB3O43889 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CREB3O43889 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CREB3O43889 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CREB3O43889 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CREB3O43889 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CREB3O43889 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CREB3O43889 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CREB3O43889 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CREB3O43889 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CREB3O43889 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CREB3O43889 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CREB3O43889 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CREB3O43889 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CREB3O43889 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CREB3O43889 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CREB3O43889 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CREB3O43889 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CREB3O43889 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CREB3O43889 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CREB3O43889 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CREB3O43889 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CREB3O43889 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CREB3O43889 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CREB3O43889 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CREB3O43889 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CREB3O43889 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CREB3O43889 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CREB3O43889 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CREB3O43889 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CREB3O43889 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CREB3O43889 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CREB3O43889 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CREB3O43889 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CREB3O43889 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CREB3O43889 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CREB3O43889 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CREB3O43889 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CREB3O43889 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CREB3O43889 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CREB3O43889 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CREB3O43889 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CREB3O43889 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CREB3O43889 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CREB3O43889 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CREB3O43889 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CREB3O43889 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CREB3O43889 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CREB3O43889 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CREB3O43889 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CREB3O43889 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CREB3O43889 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CREB3O43889 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CREB3O43889 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CREB3O43889 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CREB3O43889 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CREB3O43889 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CREB3O43889 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CREB3O43889 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CREB3O43889 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CREB3O43889 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CREB3O43889 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CREB3O43889 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CREB3O43889 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CREB3O43889 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CREB3O43889 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CREB3O43889 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CREB3O43889 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CREB3O43889 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CREB3O43889 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CREB3O43889 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CREB3O43889 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CREB3O43889 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CREB3O43889 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CREB3O43889 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CREB3O43889 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CREB3O43889 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CREB3O43889 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CREB3O43889 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CREB3O43889 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CREB3O43889 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CREB3O43889 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CREB3O43889 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CREB3O43889 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CREB3O43889 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CREB3O43889 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms