Protein–RNA interactions for Protein: O43181

NDUFS4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS4O43181 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms