Protein–RNA interactions for Protein: O15178

T, Brachyury protein, humanhuman

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Length 435 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TO15178 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TO15178 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TO15178 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TO15178 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TO15178 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TO15178 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TO15178 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TO15178 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TO15178 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TO15178 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TO15178 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TO15178 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TO15178 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TO15178 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TO15178 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TO15178 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TO15178 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TO15178 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TO15178 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TO15178 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TO15178 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TO15178 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TO15178 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TO15178 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TO15178 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TO15178 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TO15178 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TO15178 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TO15178 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TO15178 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TO15178 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TO15178 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TO15178 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TO15178 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TO15178 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TO15178 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TO15178 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TO15178 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TO15178 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TO15178 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TO15178 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TO15178 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TO15178 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TO15178 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TO15178 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TO15178 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TO15178 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TO15178 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TO15178 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TO15178 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TO15178 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TO15178 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TO15178 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TO15178 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TO15178 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TO15178 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TO15178 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TO15178 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TO15178 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TO15178 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TO15178 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TO15178 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TO15178 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TO15178 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TO15178 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TO15178 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TO15178 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TO15178 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TO15178 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TO15178 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TO15178 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TO15178 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TO15178 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TO15178 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TO15178 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TO15178 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TO15178 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TO15178 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TO15178 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TO15178 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TO15178 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TO15178 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TO15178 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TO15178 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TO15178 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TO15178 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TO15178 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TO15178 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TO15178 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TO15178 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TO15178 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TO15178 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TO15178 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TO15178 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TO15178 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TO15178 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TO15178 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TO15178 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TO15178 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TO15178 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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