Protein–RNA interactions for Protein: O15056

SYNJ2, Synaptojanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ2O15056 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYNJ2O15056 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYNJ2O15056 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYNJ2O15056 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYNJ2O15056 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYNJ2O15056 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYNJ2O15056 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYNJ2O15056 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYNJ2O15056 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYNJ2O15056 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYNJ2O15056 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYNJ2O15056 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYNJ2O15056 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYNJ2O15056 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYNJ2O15056 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SYNJ2O15056 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYNJ2O15056 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYNJ2O15056 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYNJ2O15056 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYNJ2O15056 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYNJ2O15056 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYNJ2O15056 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYNJ2O15056 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYNJ2O15056 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYNJ2O15056 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYNJ2O15056 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYNJ2O15056 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYNJ2O15056 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYNJ2O15056 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYNJ2O15056 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYNJ2O15056 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYNJ2O15056 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYNJ2O15056 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYNJ2O15056 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYNJ2O15056 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYNJ2O15056 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SYNJ2O15056 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYNJ2O15056 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYNJ2O15056 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYNJ2O15056 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYNJ2O15056 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYNJ2O15056 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYNJ2O15056 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYNJ2O15056 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYNJ2O15056 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SYNJ2O15056 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYNJ2O15056 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SYNJ2O15056 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYNJ2O15056 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYNJ2O15056 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYNJ2O15056 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SYNJ2O15056 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYNJ2O15056 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYNJ2O15056 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYNJ2O15056 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYNJ2O15056 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SYNJ2O15056 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYNJ2O15056 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SYNJ2O15056 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SYNJ2O15056 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SYNJ2O15056 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SYNJ2O15056 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SYNJ2O15056 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SYNJ2O15056 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SYNJ2O15056 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SYNJ2O15056 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SYNJ2O15056 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SYNJ2O15056 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SYNJ2O15056 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SYNJ2O15056 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SYNJ2O15056 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SYNJ2O15056 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SYNJ2O15056 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SYNJ2O15056 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SYNJ2O15056 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SYNJ2O15056 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
SYNJ2O15056 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SYNJ2O15056 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
SYNJ2O15056 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
SYNJ2O15056 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SYNJ2O15056 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SYNJ2O15056 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SYNJ2O15056 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SYNJ2O15056 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
SYNJ2O15056 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SYNJ2O15056 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
SYNJ2O15056 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SYNJ2O15056 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SYNJ2O15056 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SYNJ2O15056 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SYNJ2O15056 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SYNJ2O15056 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
SYNJ2O15056 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SYNJ2O15056 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SYNJ2O15056 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SYNJ2O15056 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYNJ2O15056 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYNJ2O15056 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYNJ2O15056 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYNJ2O15056 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms