Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SYS1-DBNDD2H3BUS1 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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