Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERVV-2B6SEH9 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms