Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVV-1B6SEH8 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms