Protein–RNA interactions for Protein: B4E171

Tetraspanin, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E171 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
B4E171 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
B4E171 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
B4E171 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
B4E171 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
B4E171 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4E171 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4E171 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
B4E171 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4E171 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4E171 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4E171 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4E171 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4E171 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4E171 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4E171 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4E171 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4E171 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
B4E171 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
B4E171 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4E171 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4E171 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4E171 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4E171 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4E171 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4E171 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4E171 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4E171 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4E171 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4E171 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4E171 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4E171 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4E171 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4E171 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
B4E171 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
B4E171 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
B4E171 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
B4E171 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
B4E171 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
B4E171 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4E171 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4E171 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4E171 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4E171 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4E171 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4E171 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4E171 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4E171 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4E171 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4E171 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4E171 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
B4E171 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4E171 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4E171 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4E171 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4E171 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4E171 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4E171 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4E171 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4E171 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
B4E171 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
B4E171 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4E171 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4E171 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
B4E171 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4E171 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4E171 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4E171 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
B4E171 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4E171 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4E171 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4E171 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4E171 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4E171 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4E171 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4E171 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4E171 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4E171 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4E171 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4E171 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4E171 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4E171 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4E171 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4E171 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
B4E171 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4E171 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
B4E171 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
B4E171 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4E171 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
B4E171 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4E171 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4E171 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4E171 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4E171 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
B4E171 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4E171 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4E171 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4E171 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4E171 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4E171 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms