Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RGPD3A6NKT7 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms