Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARID3CA6NKF2 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms