Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms