Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6U7

RNF215, RING finger protein 215, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF215Q9Y6U7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF215Q9Y6U7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF215Q9Y6U7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF215Q9Y6U7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF215Q9Y6U7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF215Q9Y6U7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF215Q9Y6U7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF215Q9Y6U7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF215Q9Y6U7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF215Q9Y6U7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF215Q9Y6U7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF215Q9Y6U7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF215Q9Y6U7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF215Q9Y6U7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF215Q9Y6U7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF215Q9Y6U7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF215Q9Y6U7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF215Q9Y6U7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF215Q9Y6U7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF215Q9Y6U7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF215Q9Y6U7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF215Q9Y6U7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF215Q9Y6U7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF215Q9Y6U7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF215Q9Y6U7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF215Q9Y6U7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF215Q9Y6U7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF215Q9Y6U7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF215Q9Y6U7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF215Q9Y6U7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF215Q9Y6U7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF215Q9Y6U7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF215Q9Y6U7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF215Q9Y6U7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF215Q9Y6U7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF215Q9Y6U7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF215Q9Y6U7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF215Q9Y6U7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF215Q9Y6U7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF215Q9Y6U7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF215Q9Y6U7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF215Q9Y6U7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF215Q9Y6U7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF215Q9Y6U7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF215Q9Y6U7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF215Q9Y6U7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF215Q9Y6U7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF215Q9Y6U7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF215Q9Y6U7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF215Q9Y6U7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF215Q9Y6U7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF215Q9Y6U7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF215Q9Y6U7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF215Q9Y6U7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF215Q9Y6U7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF215Q9Y6U7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF215Q9Y6U7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF215Q9Y6U7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF215Q9Y6U7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF215Q9Y6U7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF215Q9Y6U7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF215Q9Y6U7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF215Q9Y6U7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF215Q9Y6U7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF215Q9Y6U7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF215Q9Y6U7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF215Q9Y6U7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF215Q9Y6U7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF215Q9Y6U7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF215Q9Y6U7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF215Q9Y6U7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF215Q9Y6U7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF215Q9Y6U7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF215Q9Y6U7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF215Q9Y6U7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF215Q9Y6U7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF215Q9Y6U7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF215Q9Y6U7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF215Q9Y6U7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF215Q9Y6U7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF215Q9Y6U7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF215Q9Y6U7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF215Q9Y6U7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF215Q9Y6U7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF215Q9Y6U7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF215Q9Y6U7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF215Q9Y6U7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF215Q9Y6U7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF215Q9Y6U7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF215Q9Y6U7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF215Q9Y6U7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF215Q9Y6U7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF215Q9Y6U7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF215Q9Y6U7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF215Q9Y6U7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF215Q9Y6U7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF215Q9Y6U7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF215Q9Y6U7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF215Q9Y6U7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF215Q9Y6U7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms