Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P3

RAI2, Retinoic acid-induced protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAI2Q9Y5P3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAI2Q9Y5P3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAI2Q9Y5P3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAI2Q9Y5P3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAI2Q9Y5P3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RAI2Q9Y5P3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RAI2Q9Y5P3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RAI2Q9Y5P3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAI2Q9Y5P3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAI2Q9Y5P3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAI2Q9Y5P3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAI2Q9Y5P3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAI2Q9Y5P3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAI2Q9Y5P3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAI2Q9Y5P3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAI2Q9Y5P3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAI2Q9Y5P3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAI2Q9Y5P3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAI2Q9Y5P3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAI2Q9Y5P3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAI2Q9Y5P3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAI2Q9Y5P3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAI2Q9Y5P3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAI2Q9Y5P3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAI2Q9Y5P3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAI2Q9Y5P3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAI2Q9Y5P3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAI2Q9Y5P3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAI2Q9Y5P3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAI2Q9Y5P3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAI2Q9Y5P3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAI2Q9Y5P3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAI2Q9Y5P3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAI2Q9Y5P3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAI2Q9Y5P3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAI2Q9Y5P3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAI2Q9Y5P3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAI2Q9Y5P3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAI2Q9Y5P3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAI2Q9Y5P3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAI2Q9Y5P3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RAI2Q9Y5P3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAI2Q9Y5P3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAI2Q9Y5P3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAI2Q9Y5P3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAI2Q9Y5P3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RAI2Q9Y5P3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAI2Q9Y5P3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAI2Q9Y5P3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAI2Q9Y5P3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAI2Q9Y5P3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAI2Q9Y5P3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAI2Q9Y5P3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAI2Q9Y5P3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAI2Q9Y5P3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAI2Q9Y5P3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAI2Q9Y5P3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RAI2Q9Y5P3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RAI2Q9Y5P3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAI2Q9Y5P3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAI2Q9Y5P3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAI2Q9Y5P3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAI2Q9Y5P3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAI2Q9Y5P3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAI2Q9Y5P3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAI2Q9Y5P3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAI2Q9Y5P3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAI2Q9Y5P3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAI2Q9Y5P3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAI2Q9Y5P3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAI2Q9Y5P3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAI2Q9Y5P3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAI2Q9Y5P3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAI2Q9Y5P3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAI2Q9Y5P3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RAI2Q9Y5P3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RAI2Q9Y5P3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RAI2Q9Y5P3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAI2Q9Y5P3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAI2Q9Y5P3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAI2Q9Y5P3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAI2Q9Y5P3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAI2Q9Y5P3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAI2Q9Y5P3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RAI2Q9Y5P3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAI2Q9Y5P3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAI2Q9Y5P3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAI2Q9Y5P3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAI2Q9Y5P3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RAI2Q9Y5P3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAI2Q9Y5P3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAI2Q9Y5P3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAI2Q9Y5P3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RAI2Q9Y5P3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAI2Q9Y5P3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAI2Q9Y5P3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAI2Q9Y5P3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAI2Q9Y5P3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAI2Q9Y5P3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAI2Q9Y5P3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms