Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3R0

GRIP1, Glutamate receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIP1Q9Y3R0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIP1Q9Y3R0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIP1Q9Y3R0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIP1Q9Y3R0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIP1Q9Y3R0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIP1Q9Y3R0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIP1Q9Y3R0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIP1Q9Y3R0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIP1Q9Y3R0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIP1Q9Y3R0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIP1Q9Y3R0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIP1Q9Y3R0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIP1Q9Y3R0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIP1Q9Y3R0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIP1Q9Y3R0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIP1Q9Y3R0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIP1Q9Y3R0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIP1Q9Y3R0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIP1Q9Y3R0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIP1Q9Y3R0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIP1Q9Y3R0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIP1Q9Y3R0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIP1Q9Y3R0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIP1Q9Y3R0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIP1Q9Y3R0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIP1Q9Y3R0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIP1Q9Y3R0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIP1Q9Y3R0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIP1Q9Y3R0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIP1Q9Y3R0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIP1Q9Y3R0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIP1Q9Y3R0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIP1Q9Y3R0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRIP1Q9Y3R0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRIP1Q9Y3R0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRIP1Q9Y3R0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRIP1Q9Y3R0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GRIP1Q9Y3R0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRIP1Q9Y3R0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRIP1Q9Y3R0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIP1Q9Y3R0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIP1Q9Y3R0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIP1Q9Y3R0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIP1Q9Y3R0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIP1Q9Y3R0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIP1Q9Y3R0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIP1Q9Y3R0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIP1Q9Y3R0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIP1Q9Y3R0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIP1Q9Y3R0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIP1Q9Y3R0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIP1Q9Y3R0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIP1Q9Y3R0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIP1Q9Y3R0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIP1Q9Y3R0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIP1Q9Y3R0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIP1Q9Y3R0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIP1Q9Y3R0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIP1Q9Y3R0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIP1Q9Y3R0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIP1Q9Y3R0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIP1Q9Y3R0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIP1Q9Y3R0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIP1Q9Y3R0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIP1Q9Y3R0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIP1Q9Y3R0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIP1Q9Y3R0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIP1Q9Y3R0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIP1Q9Y3R0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIP1Q9Y3R0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIP1Q9Y3R0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIP1Q9Y3R0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIP1Q9Y3R0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIP1Q9Y3R0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIP1Q9Y3R0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
GRIP1Q9Y3R0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIP1Q9Y3R0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIP1Q9Y3R0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIP1Q9Y3R0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIP1Q9Y3R0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIP1Q9Y3R0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIP1Q9Y3R0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIP1Q9Y3R0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIP1Q9Y3R0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIP1Q9Y3R0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIP1Q9Y3R0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIP1Q9Y3R0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIP1Q9Y3R0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIP1Q9Y3R0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIP1Q9Y3R0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIP1Q9Y3R0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIP1Q9Y3R0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIP1Q9Y3R0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIP1Q9Y3R0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIP1Q9Y3R0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIP1Q9Y3R0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIP1Q9Y3R0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIP1Q9Y3R0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIP1Q9Y3R0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIP1Q9Y3R0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms