Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Q9Y3F1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Q9Y3F1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Q9Y3F1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Q9Y3F1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Q9Y3F1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Q9Y3F1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Q9Y3F1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Q9Y3F1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Q9Y3F1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Q9Y3F1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Q9Y3F1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Q9Y3F1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Q9Y3F1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Q9Y3F1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Q9Y3F1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Q9Y3F1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Q9Y3F1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Q9Y3F1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Q9Y3F1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Q9Y3F1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Q9Y3F1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Q9Y3F1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Q9Y3F1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Q9Y3F1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Q9Y3F1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Q9Y3F1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Q9Y3F1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Q9Y3F1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Q9Y3F1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Q9Y3F1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
Q9Y3F1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Q9Y3F1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Q9Y3F1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Q9Y3F1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Q9Y3F1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Q9Y3F1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Q9Y3F1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Q9Y3F1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Q9Y3F1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Q9Y3F1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Q9Y3F1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Q9Y3F1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Q9Y3F1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Q9Y3F1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Q9Y3F1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Q9Y3F1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Q9Y3F1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Q9Y3F1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Q9Y3F1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Q9Y3F1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Q9Y3F1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Q9Y3F1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Q9Y3F1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Q9Y3F1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Q9Y3F1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Q9Y3F1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Q9Y3F1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Q9Y3F1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Q9Y3F1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Q9Y3F1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Q9Y3F1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Q9Y3F1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Q9Y3F1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Q9Y3F1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Q9Y3F1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Q9Y3F1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Q9Y3F1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Q9Y3F1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Q9Y3F1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Q9Y3F1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Q9Y3F1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Q9Y3F1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Q9Y3F1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Q9Y3F1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Q9Y3F1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Q9Y3F1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Q9Y3F1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Q9Y3F1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Q9Y3F1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Q9Y3F1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Q9Y3F1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Q9Y3F1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Q9Y3F1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Q9Y3F1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Q9Y3F1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Q9Y3F1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Q9Y3F1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Q9Y3F1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Q9Y3F1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Q9Y3F1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Q9Y3F1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Q9Y3F1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Q9Y3F1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Q9Y3F1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Q9Y3F1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Q9Y3F1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Q9Y3F1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Q9Y3F1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Q9Y3F1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms