Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M5

KLHL20, Kelch-like protein 20, humanhuman

Predictions only

Length 609 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL20Q9Y2M5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL20Q9Y2M5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL20Q9Y2M5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL20Q9Y2M5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL20Q9Y2M5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL20Q9Y2M5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL20Q9Y2M5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL20Q9Y2M5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL20Q9Y2M5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL20Q9Y2M5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL20Q9Y2M5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL20Q9Y2M5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL20Q9Y2M5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL20Q9Y2M5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL20Q9Y2M5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL20Q9Y2M5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL20Q9Y2M5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL20Q9Y2M5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL20Q9Y2M5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL20Q9Y2M5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL20Q9Y2M5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL20Q9Y2M5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL20Q9Y2M5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL20Q9Y2M5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL20Q9Y2M5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL20Q9Y2M5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL20Q9Y2M5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KLHL20Q9Y2M5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL20Q9Y2M5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL20Q9Y2M5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL20Q9Y2M5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL20Q9Y2M5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL20Q9Y2M5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL20Q9Y2M5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL20Q9Y2M5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL20Q9Y2M5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL20Q9Y2M5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL20Q9Y2M5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL20Q9Y2M5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL20Q9Y2M5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL20Q9Y2M5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL20Q9Y2M5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL20Q9Y2M5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL20Q9Y2M5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL20Q9Y2M5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL20Q9Y2M5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL20Q9Y2M5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL20Q9Y2M5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL20Q9Y2M5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL20Q9Y2M5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL20Q9Y2M5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL20Q9Y2M5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL20Q9Y2M5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL20Q9Y2M5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL20Q9Y2M5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL20Q9Y2M5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL20Q9Y2M5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL20Q9Y2M5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL20Q9Y2M5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL20Q9Y2M5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL20Q9Y2M5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL20Q9Y2M5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL20Q9Y2M5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL20Q9Y2M5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL20Q9Y2M5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL20Q9Y2M5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL20Q9Y2M5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL20Q9Y2M5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL20Q9Y2M5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL20Q9Y2M5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL20Q9Y2M5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL20Q9Y2M5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL20Q9Y2M5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL20Q9Y2M5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL20Q9Y2M5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL20Q9Y2M5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL20Q9Y2M5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL20Q9Y2M5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL20Q9Y2M5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL20Q9Y2M5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL20Q9Y2M5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL20Q9Y2M5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL20Q9Y2M5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL20Q9Y2M5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL20Q9Y2M5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL20Q9Y2M5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL20Q9Y2M5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL20Q9Y2M5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL20Q9Y2M5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL20Q9Y2M5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL20Q9Y2M5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL20Q9Y2M5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL20Q9Y2M5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL20Q9Y2M5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL20Q9Y2M5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL20Q9Y2M5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL20Q9Y2M5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL20Q9Y2M5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL20Q9Y2M5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL20Q9Y2M5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms