Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L9

LRCH1, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH1Q9Y2L9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LRCH1Q9Y2L9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRCH1Q9Y2L9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRCH1Q9Y2L9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRCH1Q9Y2L9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRCH1Q9Y2L9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRCH1Q9Y2L9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRCH1Q9Y2L9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRCH1Q9Y2L9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRCH1Q9Y2L9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRCH1Q9Y2L9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRCH1Q9Y2L9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRCH1Q9Y2L9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRCH1Q9Y2L9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRCH1Q9Y2L9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRCH1Q9Y2L9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRCH1Q9Y2L9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRCH1Q9Y2L9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRCH1Q9Y2L9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRCH1Q9Y2L9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRCH1Q9Y2L9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRCH1Q9Y2L9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRCH1Q9Y2L9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRCH1Q9Y2L9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRCH1Q9Y2L9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LRCH1Q9Y2L9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRCH1Q9Y2L9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRCH1Q9Y2L9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LRCH1Q9Y2L9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRCH1Q9Y2L9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRCH1Q9Y2L9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRCH1Q9Y2L9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRCH1Q9Y2L9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRCH1Q9Y2L9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRCH1Q9Y2L9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRCH1Q9Y2L9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRCH1Q9Y2L9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRCH1Q9Y2L9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRCH1Q9Y2L9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LRCH1Q9Y2L9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRCH1Q9Y2L9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRCH1Q9Y2L9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRCH1Q9Y2L9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRCH1Q9Y2L9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRCH1Q9Y2L9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRCH1Q9Y2L9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRCH1Q9Y2L9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRCH1Q9Y2L9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRCH1Q9Y2L9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRCH1Q9Y2L9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRCH1Q9Y2L9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRCH1Q9Y2L9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRCH1Q9Y2L9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRCH1Q9Y2L9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRCH1Q9Y2L9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRCH1Q9Y2L9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRCH1Q9Y2L9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRCH1Q9Y2L9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRCH1Q9Y2L9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRCH1Q9Y2L9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRCH1Q9Y2L9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRCH1Q9Y2L9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LRCH1Q9Y2L9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRCH1Q9Y2L9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRCH1Q9Y2L9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRCH1Q9Y2L9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRCH1Q9Y2L9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRCH1Q9Y2L9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRCH1Q9Y2L9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRCH1Q9Y2L9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRCH1Q9Y2L9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRCH1Q9Y2L9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRCH1Q9Y2L9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRCH1Q9Y2L9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRCH1Q9Y2L9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRCH1Q9Y2L9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRCH1Q9Y2L9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRCH1Q9Y2L9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRCH1Q9Y2L9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRCH1Q9Y2L9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRCH1Q9Y2L9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRCH1Q9Y2L9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRCH1Q9Y2L9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRCH1Q9Y2L9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRCH1Q9Y2L9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRCH1Q9Y2L9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRCH1Q9Y2L9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRCH1Q9Y2L9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRCH1Q9Y2L9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LRCH1Q9Y2L9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRCH1Q9Y2L9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRCH1Q9Y2L9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRCH1Q9Y2L9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRCH1Q9Y2L9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRCH1Q9Y2L9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRCH1Q9Y2L9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRCH1Q9Y2L9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRCH1Q9Y2L9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRCH1Q9Y2L9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRCH1Q9Y2L9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms