Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SHOC2Q9UQ13 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SHOC2Q9UQ13 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SHOC2Q9UQ13 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SHOC2Q9UQ13 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SHOC2Q9UQ13 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SHOC2Q9UQ13 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SHOC2Q9UQ13 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SHOC2Q9UQ13 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SHOC2Q9UQ13 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHOC2Q9UQ13 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHOC2Q9UQ13 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHOC2Q9UQ13 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHOC2Q9UQ13 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHOC2Q9UQ13 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SHOC2Q9UQ13 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHOC2Q9UQ13 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHOC2Q9UQ13 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHOC2Q9UQ13 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHOC2Q9UQ13 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SHOC2Q9UQ13 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SHOC2Q9UQ13 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SHOC2Q9UQ13 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SHOC2Q9UQ13 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHOC2Q9UQ13 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHOC2Q9UQ13 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHOC2Q9UQ13 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHOC2Q9UQ13 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHOC2Q9UQ13 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHOC2Q9UQ13 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHOC2Q9UQ13 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHOC2Q9UQ13 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHOC2Q9UQ13 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHOC2Q9UQ13 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHOC2Q9UQ13 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHOC2Q9UQ13 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHOC2Q9UQ13 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHOC2Q9UQ13 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHOC2Q9UQ13 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SHOC2Q9UQ13 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SHOC2Q9UQ13 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SHOC2Q9UQ13 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SHOC2Q9UQ13 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SHOC2Q9UQ13 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SHOC2Q9UQ13 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SHOC2Q9UQ13 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SHOC2Q9UQ13 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SHOC2Q9UQ13 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SHOC2Q9UQ13 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SHOC2Q9UQ13 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SHOC2Q9UQ13 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SHOC2Q9UQ13 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SHOC2Q9UQ13 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SHOC2Q9UQ13 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SHOC2Q9UQ13 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SHOC2Q9UQ13 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SHOC2Q9UQ13 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SHOC2Q9UQ13 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SHOC2Q9UQ13 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SHOC2Q9UQ13 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SHOC2Q9UQ13 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SHOC2Q9UQ13 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SHOC2Q9UQ13 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SHOC2Q9UQ13 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SHOC2Q9UQ13 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SHOC2Q9UQ13 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SHOC2Q9UQ13 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SHOC2Q9UQ13 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SHOC2Q9UQ13 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SHOC2Q9UQ13 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SHOC2Q9UQ13 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHOC2Q9UQ13 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHOC2Q9UQ13 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHOC2Q9UQ13 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHOC2Q9UQ13 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SHOC2Q9UQ13 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHOC2Q9UQ13 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHOC2Q9UQ13 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHOC2Q9UQ13 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHOC2Q9UQ13 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHOC2Q9UQ13 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHOC2Q9UQ13 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHOC2Q9UQ13 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHOC2Q9UQ13 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHOC2Q9UQ13 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHOC2Q9UQ13 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHOC2Q9UQ13 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SHOC2Q9UQ13 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHOC2Q9UQ13 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SHOC2Q9UQ13 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHOC2Q9UQ13 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHOC2Q9UQ13 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHOC2Q9UQ13 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHOC2Q9UQ13 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHOC2Q9UQ13 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHOC2Q9UQ13 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHOC2Q9UQ13 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHOC2Q9UQ13 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHOC2Q9UQ13 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHOC2Q9UQ13 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms