Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNX12Q9UMY4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNX12Q9UMY4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNX12Q9UMY4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNX12Q9UMY4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNX12Q9UMY4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNX12Q9UMY4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNX12Q9UMY4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNX12Q9UMY4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNX12Q9UMY4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNX12Q9UMY4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNX12Q9UMY4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNX12Q9UMY4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNX12Q9UMY4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNX12Q9UMY4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNX12Q9UMY4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNX12Q9UMY4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNX12Q9UMY4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNX12Q9UMY4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNX12Q9UMY4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNX12Q9UMY4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNX12Q9UMY4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNX12Q9UMY4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SNX12Q9UMY4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNX12Q9UMY4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNX12Q9UMY4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNX12Q9UMY4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNX12Q9UMY4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNX12Q9UMY4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNX12Q9UMY4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX12Q9UMY4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX12Q9UMY4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX12Q9UMY4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX12Q9UMY4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX12Q9UMY4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNX12Q9UMY4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNX12Q9UMY4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNX12Q9UMY4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNX12Q9UMY4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNX12Q9UMY4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNX12Q9UMY4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNX12Q9UMY4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNX12Q9UMY4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNX12Q9UMY4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNX12Q9UMY4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNX12Q9UMY4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNX12Q9UMY4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNX12Q9UMY4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNX12Q9UMY4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNX12Q9UMY4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNX12Q9UMY4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SNX12Q9UMY4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SNX12Q9UMY4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SNX12Q9UMY4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNX12Q9UMY4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNX12Q9UMY4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNX12Q9UMY4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNX12Q9UMY4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNX12Q9UMY4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNX12Q9UMY4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNX12Q9UMY4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNX12Q9UMY4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNX12Q9UMY4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNX12Q9UMY4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNX12Q9UMY4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SNX12Q9UMY4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNX12Q9UMY4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNX12Q9UMY4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNX12Q9UMY4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNX12Q9UMY4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNX12Q9UMY4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNX12Q9UMY4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNX12Q9UMY4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNX12Q9UMY4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNX12Q9UMY4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNX12Q9UMY4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNX12Q9UMY4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNX12Q9UMY4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNX12Q9UMY4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX12Q9UMY4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX12Q9UMY4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX12Q9UMY4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX12Q9UMY4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX12Q9UMY4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX12Q9UMY4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNX12Q9UMY4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNX12Q9UMY4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNX12Q9UMY4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNX12Q9UMY4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNX12Q9UMY4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX12Q9UMY4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX12Q9UMY4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX12Q9UMY4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX12Q9UMY4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX12Q9UMY4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX12Q9UMY4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX12Q9UMY4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX12Q9UMY4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNX12Q9UMY4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SNX12Q9UMY4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms