Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM07

PADI4, Protein-arginine deiminase type-4, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI4Q9UM07 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PADI4Q9UM07 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PADI4Q9UM07 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PADI4Q9UM07 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PADI4Q9UM07 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PADI4Q9UM07 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PADI4Q9UM07 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PADI4Q9UM07 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PADI4Q9UM07 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PADI4Q9UM07 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PADI4Q9UM07 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PADI4Q9UM07 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PADI4Q9UM07 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PADI4Q9UM07 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PADI4Q9UM07 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PADI4Q9UM07 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PADI4Q9UM07 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PADI4Q9UM07 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PADI4Q9UM07 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PADI4Q9UM07 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PADI4Q9UM07 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PADI4Q9UM07 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PADI4Q9UM07 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PADI4Q9UM07 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PADI4Q9UM07 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PADI4Q9UM07 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PADI4Q9UM07 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PADI4Q9UM07 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PADI4Q9UM07 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PADI4Q9UM07 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PADI4Q9UM07 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PADI4Q9UM07 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PADI4Q9UM07 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
PADI4Q9UM07 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PADI4Q9UM07 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PADI4Q9UM07 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PADI4Q9UM07 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PADI4Q9UM07 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PADI4Q9UM07 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PADI4Q9UM07 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PADI4Q9UM07 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PADI4Q9UM07 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PADI4Q9UM07 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PADI4Q9UM07 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PADI4Q9UM07 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PADI4Q9UM07 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PADI4Q9UM07 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PADI4Q9UM07 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PADI4Q9UM07 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PADI4Q9UM07 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PADI4Q9UM07 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PADI4Q9UM07 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PADI4Q9UM07 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PADI4Q9UM07 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PADI4Q9UM07 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PADI4Q9UM07 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PADI4Q9UM07 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PADI4Q9UM07 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PADI4Q9UM07 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PADI4Q9UM07 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PADI4Q9UM07 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PADI4Q9UM07 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PADI4Q9UM07 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PADI4Q9UM07 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PADI4Q9UM07 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PADI4Q9UM07 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PADI4Q9UM07 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PADI4Q9UM07 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PADI4Q9UM07 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PADI4Q9UM07 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PADI4Q9UM07 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PADI4Q9UM07 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PADI4Q9UM07 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PADI4Q9UM07 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PADI4Q9UM07 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PADI4Q9UM07 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PADI4Q9UM07 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PADI4Q9UM07 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PADI4Q9UM07 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PADI4Q9UM07 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PADI4Q9UM07 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PADI4Q9UM07 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PADI4Q9UM07 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PADI4Q9UM07 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PADI4Q9UM07 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PADI4Q9UM07 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PADI4Q9UM07 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PADI4Q9UM07 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PADI4Q9UM07 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PADI4Q9UM07 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PADI4Q9UM07 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PADI4Q9UM07 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PADI4Q9UM07 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PADI4Q9UM07 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PADI4Q9UM07 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PADI4Q9UM07 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PADI4Q9UM07 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PADI4Q9UM07 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PADI4Q9UM07 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PADI4Q9UM07 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms