Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV3

CIZ1, Cip1-interacting zinc finger protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIZ1Q9ULV3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CIZ1Q9ULV3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CIZ1Q9ULV3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CIZ1Q9ULV3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CIZ1Q9ULV3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CIZ1Q9ULV3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CIZ1Q9ULV3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
CIZ1Q9ULV3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CIZ1Q9ULV3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CIZ1Q9ULV3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CIZ1Q9ULV3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CIZ1Q9ULV3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CIZ1Q9ULV3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CIZ1Q9ULV3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CIZ1Q9ULV3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CIZ1Q9ULV3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CIZ1Q9ULV3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CIZ1Q9ULV3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CIZ1Q9ULV3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CIZ1Q9ULV3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CIZ1Q9ULV3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CIZ1Q9ULV3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CIZ1Q9ULV3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CIZ1Q9ULV3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CIZ1Q9ULV3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CIZ1Q9ULV3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CIZ1Q9ULV3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CIZ1Q9ULV3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CIZ1Q9ULV3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CIZ1Q9ULV3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CIZ1Q9ULV3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CIZ1Q9ULV3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CIZ1Q9ULV3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CIZ1Q9ULV3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CIZ1Q9ULV3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CIZ1Q9ULV3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CIZ1Q9ULV3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CIZ1Q9ULV3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CIZ1Q9ULV3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CIZ1Q9ULV3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CIZ1Q9ULV3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CIZ1Q9ULV3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CIZ1Q9ULV3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CIZ1Q9ULV3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CIZ1Q9ULV3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CIZ1Q9ULV3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CIZ1Q9ULV3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CIZ1Q9ULV3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CIZ1Q9ULV3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CIZ1Q9ULV3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CIZ1Q9ULV3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CIZ1Q9ULV3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CIZ1Q9ULV3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CIZ1Q9ULV3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CIZ1Q9ULV3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CIZ1Q9ULV3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CIZ1Q9ULV3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CIZ1Q9ULV3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CIZ1Q9ULV3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CIZ1Q9ULV3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CIZ1Q9ULV3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CIZ1Q9ULV3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CIZ1Q9ULV3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CIZ1Q9ULV3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CIZ1Q9ULV3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CIZ1Q9ULV3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CIZ1Q9ULV3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CIZ1Q9ULV3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CIZ1Q9ULV3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CIZ1Q9ULV3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CIZ1Q9ULV3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CIZ1Q9ULV3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CIZ1Q9ULV3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CIZ1Q9ULV3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CIZ1Q9ULV3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CIZ1Q9ULV3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CIZ1Q9ULV3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CIZ1Q9ULV3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CIZ1Q9ULV3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CIZ1Q9ULV3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CIZ1Q9ULV3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CIZ1Q9ULV3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CIZ1Q9ULV3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CIZ1Q9ULV3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CIZ1Q9ULV3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CIZ1Q9ULV3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CIZ1Q9ULV3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CIZ1Q9ULV3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CIZ1Q9ULV3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CIZ1Q9ULV3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CIZ1Q9ULV3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CIZ1Q9ULV3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CIZ1Q9ULV3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CIZ1Q9ULV3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CIZ1Q9ULV3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CIZ1Q9ULV3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CIZ1Q9ULV3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CIZ1Q9ULV3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CIZ1Q9ULV3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CIZ1Q9ULV3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 227.8 ms