Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL41

PNMA3, Paraneoplastic antigen Ma3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA3Q9UL41 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PNMA3Q9UL41 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PNMA3Q9UL41 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PNMA3Q9UL41 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PNMA3Q9UL41 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PNMA3Q9UL41 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PNMA3Q9UL41 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PNMA3Q9UL41 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PNMA3Q9UL41 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PNMA3Q9UL41 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PNMA3Q9UL41 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PNMA3Q9UL41 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PNMA3Q9UL41 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PNMA3Q9UL41 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PNMA3Q9UL41 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PNMA3Q9UL41 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
PNMA3Q9UL41 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PNMA3Q9UL41 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
PNMA3Q9UL41 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PNMA3Q9UL41 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PNMA3Q9UL41 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PNMA3Q9UL41 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PNMA3Q9UL41 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PNMA3Q9UL41 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PNMA3Q9UL41 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PNMA3Q9UL41 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PNMA3Q9UL41 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PNMA3Q9UL41 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
PNMA3Q9UL41 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
PNMA3Q9UL41 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PNMA3Q9UL41 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PNMA3Q9UL41 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PNMA3Q9UL41 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PNMA3Q9UL41 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PNMA3Q9UL41 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PNMA3Q9UL41 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PNMA3Q9UL41 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PNMA3Q9UL41 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PNMA3Q9UL41 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PNMA3Q9UL41 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PNMA3Q9UL41 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PNMA3Q9UL41 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PNMA3Q9UL41 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PNMA3Q9UL41 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PNMA3Q9UL41 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PNMA3Q9UL41 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PNMA3Q9UL41 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
PNMA3Q9UL41 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PNMA3Q9UL41 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PNMA3Q9UL41 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PNMA3Q9UL41 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PNMA3Q9UL41 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PNMA3Q9UL41 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PNMA3Q9UL41 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PNMA3Q9UL41 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PNMA3Q9UL41 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PNMA3Q9UL41 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PNMA3Q9UL41 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PNMA3Q9UL41 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PNMA3Q9UL41 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PNMA3Q9UL41 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PNMA3Q9UL41 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PNMA3Q9UL41 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PNMA3Q9UL41 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PNMA3Q9UL41 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PNMA3Q9UL41 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PNMA3Q9UL41 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PNMA3Q9UL41 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PNMA3Q9UL41 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PNMA3Q9UL41 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PNMA3Q9UL41 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PNMA3Q9UL41 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PNMA3Q9UL41 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PNMA3Q9UL41 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PNMA3Q9UL41 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PNMA3Q9UL41 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PNMA3Q9UL41 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PNMA3Q9UL41 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PNMA3Q9UL41 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PNMA3Q9UL41 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PNMA3Q9UL41 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PNMA3Q9UL41 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PNMA3Q9UL41 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PNMA3Q9UL41 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PNMA3Q9UL41 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PNMA3Q9UL41 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PNMA3Q9UL41 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PNMA3Q9UL41 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PNMA3Q9UL41 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PNMA3Q9UL41 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PNMA3Q9UL41 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PNMA3Q9UL41 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PNMA3Q9UL41 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PNMA3Q9UL41 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PNMA3Q9UL41 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PNMA3Q9UL41 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PNMA3Q9UL41 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PNMA3Q9UL41 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PNMA3Q9UL41 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PNMA3Q9UL41 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms