Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH03

SEPT3, Neuronal-specific septin-3, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEPT3Q9UH03 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SEPT3Q9UH03 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEPT3Q9UH03 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEPT3Q9UH03 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEPT3Q9UH03 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEPT3Q9UH03 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEPT3Q9UH03 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEPT3Q9UH03 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEPT3Q9UH03 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEPT3Q9UH03 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SEPT3Q9UH03 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SEPT3Q9UH03 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SEPT3Q9UH03 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEPT3Q9UH03 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEPT3Q9UH03 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SEPT3Q9UH03 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEPT3Q9UH03 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEPT3Q9UH03 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEPT3Q9UH03 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEPT3Q9UH03 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEPT3Q9UH03 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEPT3Q9UH03 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEPT3Q9UH03 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEPT3Q9UH03 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEPT3Q9UH03 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEPT3Q9UH03 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEPT3Q9UH03 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEPT3Q9UH03 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEPT3Q9UH03 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SEPT3Q9UH03 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEPT3Q9UH03 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEPT3Q9UH03 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEPT3Q9UH03 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEPT3Q9UH03 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEPT3Q9UH03 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEPT3Q9UH03 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SEPT3Q9UH03 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEPT3Q9UH03 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SEPT3Q9UH03 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEPT3Q9UH03 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEPT3Q9UH03 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEPT3Q9UH03 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEPT3Q9UH03 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEPT3Q9UH03 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SEPT3Q9UH03 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEPT3Q9UH03 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEPT3Q9UH03 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEPT3Q9UH03 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEPT3Q9UH03 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEPT3Q9UH03 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEPT3Q9UH03 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEPT3Q9UH03 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEPT3Q9UH03 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEPT3Q9UH03 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEPT3Q9UH03 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEPT3Q9UH03 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEPT3Q9UH03 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEPT3Q9UH03 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEPT3Q9UH03 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEPT3Q9UH03 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEPT3Q9UH03 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEPT3Q9UH03 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEPT3Q9UH03 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEPT3Q9UH03 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEPT3Q9UH03 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEPT3Q9UH03 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEPT3Q9UH03 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEPT3Q9UH03 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEPT3Q9UH03 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEPT3Q9UH03 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEPT3Q9UH03 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEPT3Q9UH03 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEPT3Q9UH03 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEPT3Q9UH03 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEPT3Q9UH03 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEPT3Q9UH03 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SEPT3Q9UH03 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEPT3Q9UH03 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEPT3Q9UH03 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEPT3Q9UH03 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEPT3Q9UH03 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEPT3Q9UH03 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEPT3Q9UH03 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SEPT3Q9UH03 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEPT3Q9UH03 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SEPT3Q9UH03 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEPT3Q9UH03 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEPT3Q9UH03 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEPT3Q9UH03 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEPT3Q9UH03 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEPT3Q9UH03 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEPT3Q9UH03 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEPT3Q9UH03 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEPT3Q9UH03 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEPT3Q9UH03 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEPT3Q9UH03 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEPT3Q9UH03 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEPT3Q9UH03 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEPT3Q9UH03 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEPT3Q9UH03 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms