Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
KDM5BQ9UGL1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC38.54■■■■□ 3.76
KDM5BQ9UGL1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
KDM5BQ9UGL1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
KDM5BQ9UGL1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
KDM5BQ9UGL1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
KDM5BQ9UGL1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
KDM5BQ9UGL1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
KDM5BQ9UGL1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
KDM5BQ9UGL1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC38.52■■■■□ 3.76
KDM5BQ9UGL1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
KDM5BQ9UGL1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC38.52■■■■□ 3.76
KDM5BQ9UGL1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
KDM5BQ9UGL1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC38.52■■■■□ 3.76
KDM5BQ9UGL1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC38.51■■■■□ 3.76
KDM5BQ9UGL1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
KDM5BQ9UGL1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.75
KDM5BQ9UGL1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.5■■■■□ 3.75
KDM5BQ9UGL1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
KDM5BQ9UGL1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC38.5■■■■□ 3.75
KDM5BQ9UGL1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC38.49■■■■□ 3.75
KDM5BQ9UGL1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC38.49■■■■□ 3.75
KDM5BQ9UGL1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
KDM5BQ9UGL1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
KDM5BQ9UGL1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
KDM5BQ9UGL1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC38.49■■■■□ 3.75
KDM5BQ9UGL1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC38.48■■■■□ 3.75
KDM5BQ9UGL1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC38.48■■■■□ 3.75
KDM5BQ9UGL1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
KDM5BQ9UGL1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC38.48■■■■□ 3.75
KDM5BQ9UGL1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
KDM5BQ9UGL1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
KDM5BQ9UGL1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC38.47■■■■□ 3.75
KDM5BQ9UGL1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
KDM5BQ9UGL1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
KDM5BQ9UGL1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC38.45■■■■□ 3.75
KDM5BQ9UGL1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.75
KDM5BQ9UGL1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.75
KDM5BQ9UGL1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
KDM5BQ9UGL1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.75
KDM5BQ9UGL1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC38.44■■■■□ 3.74
KDM5BQ9UGL1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC38.44■■■■□ 3.74
KDM5BQ9UGL1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
KDM5BQ9UGL1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC38.43■■■■□ 3.74
KDM5BQ9UGL1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC38.43■■■■□ 3.74
KDM5BQ9UGL1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
KDM5BQ9UGL1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC38.43■■■■□ 3.74
KDM5BQ9UGL1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
KDM5BQ9UGL1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
KDM5BQ9UGL1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
KDM5BQ9UGL1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
KDM5BQ9UGL1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.42■■■■□ 3.74
KDM5BQ9UGL1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC38.42■■■■□ 3.74
KDM5BQ9UGL1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
KDM5BQ9UGL1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
KDM5BQ9UGL1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
KDM5BQ9UGL1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
KDM5BQ9UGL1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
KDM5BQ9UGL1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
KDM5BQ9UGL1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
KDM5BQ9UGL1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
KDM5BQ9UGL1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC38.4■■■■□ 3.74
KDM5BQ9UGL1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
KDM5BQ9UGL1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC38.39■■■■□ 3.74
KDM5BQ9UGL1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
KDM5BQ9UGL1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC38.39■■■■□ 3.74
KDM5BQ9UGL1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC38.38■■■■□ 3.74
KDM5BQ9UGL1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC38.38■■■■□ 3.74
KDM5BQ9UGL1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
KDM5BQ9UGL1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
KDM5BQ9UGL1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
KDM5BQ9UGL1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
KDM5BQ9UGL1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
KDM5BQ9UGL1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC38.37■■■■□ 3.73
KDM5BQ9UGL1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
KDM5BQ9UGL1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
KDM5BQ9UGL1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC38.36■■■■□ 3.73
KDM5BQ9UGL1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC38.36■■■■□ 3.73
KDM5BQ9UGL1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
KDM5BQ9UGL1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC38.36■■■■□ 3.73
KDM5BQ9UGL1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC38.35■■■■□ 3.73
KDM5BQ9UGL1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
KDM5BQ9UGL1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC38.34■■■■□ 3.73
KDM5BQ9UGL1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
KDM5BQ9UGL1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC38.33■■■■□ 3.73
KDM5BQ9UGL1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
KDM5BQ9UGL1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
KDM5BQ9UGL1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
KDM5BQ9UGL1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
KDM5BQ9UGL1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC38.31■■■■□ 3.72
KDM5BQ9UGL1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
KDM5BQ9UGL1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
KDM5BQ9UGL1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC38.3■■■■□ 3.72
KDM5BQ9UGL1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
KDM5BQ9UGL1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
KDM5BQ9UGL1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
KDM5BQ9UGL1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
KDM5BQ9UGL1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC38.29■■■■□ 3.72
KDM5BQ9UGL1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
KDM5BQ9UGL1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC38.29■■■■□ 3.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms