Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX2

DUX4, Double homeobox protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4Q9UBX2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
DUX4Q9UBX2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DUX4Q9UBX2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DUX4Q9UBX2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DUX4Q9UBX2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
DUX4Q9UBX2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DUX4Q9UBX2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DUX4Q9UBX2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DUX4Q9UBX2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DUX4Q9UBX2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DUX4Q9UBX2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DUX4Q9UBX2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DUX4Q9UBX2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DUX4Q9UBX2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DUX4Q9UBX2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DUX4Q9UBX2 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DUX4Q9UBX2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DUX4Q9UBX2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DUX4Q9UBX2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DUX4Q9UBX2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DUX4Q9UBX2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DUX4Q9UBX2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DUX4Q9UBX2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DUX4Q9UBX2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DUX4Q9UBX2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
DUX4Q9UBX2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
DUX4Q9UBX2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DUX4Q9UBX2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DUX4Q9UBX2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DUX4Q9UBX2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DUX4Q9UBX2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DUX4Q9UBX2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DUX4Q9UBX2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
DUX4Q9UBX2 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DUX4Q9UBX2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DUX4Q9UBX2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DUX4Q9UBX2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DUX4Q9UBX2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DUX4Q9UBX2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DUX4Q9UBX2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DUX4Q9UBX2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
DUX4Q9UBX2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DUX4Q9UBX2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DUX4Q9UBX2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DUX4Q9UBX2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DUX4Q9UBX2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DUX4Q9UBX2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DUX4Q9UBX2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DUX4Q9UBX2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
DUX4Q9UBX2 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DUX4Q9UBX2 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DUX4Q9UBX2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DUX4Q9UBX2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DUX4Q9UBX2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DUX4Q9UBX2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
DUX4Q9UBX2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DUX4Q9UBX2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
DUX4Q9UBX2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DUX4Q9UBX2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
DUX4Q9UBX2 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DUX4Q9UBX2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DUX4Q9UBX2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DUX4Q9UBX2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DUX4Q9UBX2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DUX4Q9UBX2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DUX4Q9UBX2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DUX4Q9UBX2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DUX4Q9UBX2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DUX4Q9UBX2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DUX4Q9UBX2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DUX4Q9UBX2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DUX4Q9UBX2 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DUX4Q9UBX2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DUX4Q9UBX2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DUX4Q9UBX2 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DUX4Q9UBX2 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DUX4Q9UBX2 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DUX4Q9UBX2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DUX4Q9UBX2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DUX4Q9UBX2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DUX4Q9UBX2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DUX4Q9UBX2 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DUX4Q9UBX2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DUX4Q9UBX2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DUX4Q9UBX2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DUX4Q9UBX2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DUX4Q9UBX2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DUX4Q9UBX2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DUX4Q9UBX2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DUX4Q9UBX2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DUX4Q9UBX2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
DUX4Q9UBX2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DUX4Q9UBX2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DUX4Q9UBX2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DUX4Q9UBX2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DUX4Q9UBX2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DUX4Q9UBX2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DUX4Q9UBX2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DUX4Q9UBX2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DUX4Q9UBX2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms