Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU6

FAM8A1, Protein FAM8A1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM8A1Q9UBU6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM8A1Q9UBU6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM8A1Q9UBU6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM8A1Q9UBU6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM8A1Q9UBU6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM8A1Q9UBU6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM8A1Q9UBU6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM8A1Q9UBU6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM8A1Q9UBU6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM8A1Q9UBU6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM8A1Q9UBU6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM8A1Q9UBU6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM8A1Q9UBU6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM8A1Q9UBU6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM8A1Q9UBU6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM8A1Q9UBU6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM8A1Q9UBU6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM8A1Q9UBU6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM8A1Q9UBU6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM8A1Q9UBU6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM8A1Q9UBU6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM8A1Q9UBU6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM8A1Q9UBU6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM8A1Q9UBU6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM8A1Q9UBU6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM8A1Q9UBU6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FAM8A1Q9UBU6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM8A1Q9UBU6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM8A1Q9UBU6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM8A1Q9UBU6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM8A1Q9UBU6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM8A1Q9UBU6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM8A1Q9UBU6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM8A1Q9UBU6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM8A1Q9UBU6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM8A1Q9UBU6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM8A1Q9UBU6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM8A1Q9UBU6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM8A1Q9UBU6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM8A1Q9UBU6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM8A1Q9UBU6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM8A1Q9UBU6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM8A1Q9UBU6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM8A1Q9UBU6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM8A1Q9UBU6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM8A1Q9UBU6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM8A1Q9UBU6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM8A1Q9UBU6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM8A1Q9UBU6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM8A1Q9UBU6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM8A1Q9UBU6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM8A1Q9UBU6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM8A1Q9UBU6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM8A1Q9UBU6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM8A1Q9UBU6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM8A1Q9UBU6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM8A1Q9UBU6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM8A1Q9UBU6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM8A1Q9UBU6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM8A1Q9UBU6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM8A1Q9UBU6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM8A1Q9UBU6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM8A1Q9UBU6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM8A1Q9UBU6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM8A1Q9UBU6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM8A1Q9UBU6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM8A1Q9UBU6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM8A1Q9UBU6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM8A1Q9UBU6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM8A1Q9UBU6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM8A1Q9UBU6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM8A1Q9UBU6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM8A1Q9UBU6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM8A1Q9UBU6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM8A1Q9UBU6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM8A1Q9UBU6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM8A1Q9UBU6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM8A1Q9UBU6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM8A1Q9UBU6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM8A1Q9UBU6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM8A1Q9UBU6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM8A1Q9UBU6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM8A1Q9UBU6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM8A1Q9UBU6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM8A1Q9UBU6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM8A1Q9UBU6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM8A1Q9UBU6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM8A1Q9UBU6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM8A1Q9UBU6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM8A1Q9UBU6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM8A1Q9UBU6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM8A1Q9UBU6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM8A1Q9UBU6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM8A1Q9UBU6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM8A1Q9UBU6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM8A1Q9UBU6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM8A1Q9UBU6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM8A1Q9UBU6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM8A1Q9UBU6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM8A1Q9UBU6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms