Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBM8

MGAT4C, Alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 4-beta-N-acetylglucosaminyltransferase C, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGAT4CQ9UBM8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MGAT4CQ9UBM8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MGAT4CQ9UBM8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MGAT4CQ9UBM8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MGAT4CQ9UBM8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MGAT4CQ9UBM8 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MGAT4CQ9UBM8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MGAT4CQ9UBM8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MGAT4CQ9UBM8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MGAT4CQ9UBM8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MGAT4CQ9UBM8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MGAT4CQ9UBM8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MGAT4CQ9UBM8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MGAT4CQ9UBM8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MGAT4CQ9UBM8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MGAT4CQ9UBM8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MGAT4CQ9UBM8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MGAT4CQ9UBM8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MGAT4CQ9UBM8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MGAT4CQ9UBM8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MGAT4CQ9UBM8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MGAT4CQ9UBM8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MGAT4CQ9UBM8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MGAT4CQ9UBM8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MGAT4CQ9UBM8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
MGAT4CQ9UBM8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
MGAT4CQ9UBM8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MGAT4CQ9UBM8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MGAT4CQ9UBM8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MGAT4CQ9UBM8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MGAT4CQ9UBM8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MGAT4CQ9UBM8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MGAT4CQ9UBM8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MGAT4CQ9UBM8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MGAT4CQ9UBM8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MGAT4CQ9UBM8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MGAT4CQ9UBM8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MGAT4CQ9UBM8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MGAT4CQ9UBM8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MGAT4CQ9UBM8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MGAT4CQ9UBM8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MGAT4CQ9UBM8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MGAT4CQ9UBM8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MGAT4CQ9UBM8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MGAT4CQ9UBM8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MGAT4CQ9UBM8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MGAT4CQ9UBM8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MGAT4CQ9UBM8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MGAT4CQ9UBM8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MGAT4CQ9UBM8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MGAT4CQ9UBM8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MGAT4CQ9UBM8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MGAT4CQ9UBM8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MGAT4CQ9UBM8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MGAT4CQ9UBM8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MGAT4CQ9UBM8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MGAT4CQ9UBM8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MGAT4CQ9UBM8 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MGAT4CQ9UBM8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MGAT4CQ9UBM8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MGAT4CQ9UBM8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MGAT4CQ9UBM8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MGAT4CQ9UBM8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MGAT4CQ9UBM8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MGAT4CQ9UBM8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MGAT4CQ9UBM8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MGAT4CQ9UBM8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MGAT4CQ9UBM8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MGAT4CQ9UBM8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MGAT4CQ9UBM8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MGAT4CQ9UBM8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MGAT4CQ9UBM8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MGAT4CQ9UBM8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MGAT4CQ9UBM8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MGAT4CQ9UBM8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MGAT4CQ9UBM8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MGAT4CQ9UBM8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MGAT4CQ9UBM8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MGAT4CQ9UBM8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MGAT4CQ9UBM8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MGAT4CQ9UBM8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MGAT4CQ9UBM8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MGAT4CQ9UBM8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MGAT4CQ9UBM8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MGAT4CQ9UBM8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MGAT4CQ9UBM8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MGAT4CQ9UBM8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MGAT4CQ9UBM8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MGAT4CQ9UBM8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MGAT4CQ9UBM8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MGAT4CQ9UBM8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MGAT4CQ9UBM8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
MGAT4CQ9UBM8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MGAT4CQ9UBM8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MGAT4CQ9UBM8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MGAT4CQ9UBM8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MGAT4CQ9UBM8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MGAT4CQ9UBM8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MGAT4CQ9UBM8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MGAT4CQ9UBM8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms