Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2I0

CPSF2, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF2Q9P2I0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CPSF2Q9P2I0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CPSF2Q9P2I0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CPSF2Q9P2I0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CPSF2Q9P2I0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CPSF2Q9P2I0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPSF2Q9P2I0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPSF2Q9P2I0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPSF2Q9P2I0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPSF2Q9P2I0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPSF2Q9P2I0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPSF2Q9P2I0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPSF2Q9P2I0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPSF2Q9P2I0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPSF2Q9P2I0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CPSF2Q9P2I0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CPSF2Q9P2I0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CPSF2Q9P2I0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CPSF2Q9P2I0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CPSF2Q9P2I0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CPSF2Q9P2I0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CPSF2Q9P2I0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CPSF2Q9P2I0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CPSF2Q9P2I0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CPSF2Q9P2I0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CPSF2Q9P2I0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CPSF2Q9P2I0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CPSF2Q9P2I0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CPSF2Q9P2I0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CPSF2Q9P2I0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CPSF2Q9P2I0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CPSF2Q9P2I0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CPSF2Q9P2I0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CPSF2Q9P2I0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CPSF2Q9P2I0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CPSF2Q9P2I0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CPSF2Q9P2I0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CPSF2Q9P2I0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CPSF2Q9P2I0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CPSF2Q9P2I0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CPSF2Q9P2I0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CPSF2Q9P2I0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CPSF2Q9P2I0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CPSF2Q9P2I0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CPSF2Q9P2I0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CPSF2Q9P2I0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CPSF2Q9P2I0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CPSF2Q9P2I0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CPSF2Q9P2I0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CPSF2Q9P2I0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CPSF2Q9P2I0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CPSF2Q9P2I0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CPSF2Q9P2I0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CPSF2Q9P2I0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CPSF2Q9P2I0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CPSF2Q9P2I0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CPSF2Q9P2I0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CPSF2Q9P2I0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CPSF2Q9P2I0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CPSF2Q9P2I0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CPSF2Q9P2I0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CPSF2Q9P2I0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CPSF2Q9P2I0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CPSF2Q9P2I0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CPSF2Q9P2I0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CPSF2Q9P2I0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CPSF2Q9P2I0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CPSF2Q9P2I0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CPSF2Q9P2I0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CPSF2Q9P2I0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CPSF2Q9P2I0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CPSF2Q9P2I0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CPSF2Q9P2I0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CPSF2Q9P2I0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CPSF2Q9P2I0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CPSF2Q9P2I0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CPSF2Q9P2I0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CPSF2Q9P2I0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CPSF2Q9P2I0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CPSF2Q9P2I0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CPSF2Q9P2I0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CPSF2Q9P2I0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CPSF2Q9P2I0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CPSF2Q9P2I0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CPSF2Q9P2I0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CPSF2Q9P2I0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CPSF2Q9P2I0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CPSF2Q9P2I0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CPSF2Q9P2I0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CPSF2Q9P2I0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CPSF2Q9P2I0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CPSF2Q9P2I0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CPSF2Q9P2I0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CPSF2Q9P2I0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CPSF2Q9P2I0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CPSF2Q9P2I0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CPSF2Q9P2I0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CPSF2Q9P2I0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CPSF2Q9P2I0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CPSF2Q9P2I0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.1 ms