Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYK5

MRPL39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL39Q9NYK5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRPL39Q9NYK5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRPL39Q9NYK5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRPL39Q9NYK5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRPL39Q9NYK5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRPL39Q9NYK5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRPL39Q9NYK5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MRPL39Q9NYK5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRPL39Q9NYK5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRPL39Q9NYK5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRPL39Q9NYK5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MRPL39Q9NYK5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MRPL39Q9NYK5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MRPL39Q9NYK5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MRPL39Q9NYK5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MRPL39Q9NYK5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MRPL39Q9NYK5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MRPL39Q9NYK5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRPL39Q9NYK5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRPL39Q9NYK5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRPL39Q9NYK5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRPL39Q9NYK5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRPL39Q9NYK5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRPL39Q9NYK5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRPL39Q9NYK5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRPL39Q9NYK5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRPL39Q9NYK5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRPL39Q9NYK5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
MRPL39Q9NYK5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MRPL39Q9NYK5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MRPL39Q9NYK5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MRPL39Q9NYK5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MRPL39Q9NYK5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MRPL39Q9NYK5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MRPL39Q9NYK5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MRPL39Q9NYK5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MRPL39Q9NYK5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MRPL39Q9NYK5 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MRPL39Q9NYK5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MRPL39Q9NYK5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MRPL39Q9NYK5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MRPL39Q9NYK5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MRPL39Q9NYK5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MRPL39Q9NYK5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MRPL39Q9NYK5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MRPL39Q9NYK5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MRPL39Q9NYK5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MRPL39Q9NYK5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MRPL39Q9NYK5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MRPL39Q9NYK5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MRPL39Q9NYK5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MRPL39Q9NYK5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MRPL39Q9NYK5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MRPL39Q9NYK5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
MRPL39Q9NYK5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MRPL39Q9NYK5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MRPL39Q9NYK5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MRPL39Q9NYK5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MRPL39Q9NYK5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MRPL39Q9NYK5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MRPL39Q9NYK5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MRPL39Q9NYK5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MRPL39Q9NYK5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MRPL39Q9NYK5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MRPL39Q9NYK5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MRPL39Q9NYK5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MRPL39Q9NYK5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
MRPL39Q9NYK5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MRPL39Q9NYK5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MRPL39Q9NYK5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MRPL39Q9NYK5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MRPL39Q9NYK5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MRPL39Q9NYK5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MRPL39Q9NYK5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MRPL39Q9NYK5 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MRPL39Q9NYK5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MRPL39Q9NYK5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
MRPL39Q9NYK5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MRPL39Q9NYK5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MRPL39Q9NYK5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MRPL39Q9NYK5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRPL39Q9NYK5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRPL39Q9NYK5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRPL39Q9NYK5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
MRPL39Q9NYK5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
MRPL39Q9NYK5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MRPL39Q9NYK5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MRPL39Q9NYK5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MRPL39Q9NYK5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MRPL39Q9NYK5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MRPL39Q9NYK5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MRPL39Q9NYK5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MRPL39Q9NYK5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MRPL39Q9NYK5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MRPL39Q9NYK5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MRPL39Q9NYK5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRPL39Q9NYK5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRPL39Q9NYK5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRPL39Q9NYK5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRPL39Q9NYK5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms