Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYH9

UTP6, U3 small nucleolar RNA-associated protein 6 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP6Q9NYH9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UTP6Q9NYH9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UTP6Q9NYH9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UTP6Q9NYH9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UTP6Q9NYH9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UTP6Q9NYH9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UTP6Q9NYH9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UTP6Q9NYH9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UTP6Q9NYH9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UTP6Q9NYH9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UTP6Q9NYH9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UTP6Q9NYH9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UTP6Q9NYH9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UTP6Q9NYH9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UTP6Q9NYH9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
UTP6Q9NYH9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
UTP6Q9NYH9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UTP6Q9NYH9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UTP6Q9NYH9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
UTP6Q9NYH9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UTP6Q9NYH9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UTP6Q9NYH9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UTP6Q9NYH9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UTP6Q9NYH9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UTP6Q9NYH9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UTP6Q9NYH9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UTP6Q9NYH9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UTP6Q9NYH9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UTP6Q9NYH9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UTP6Q9NYH9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UTP6Q9NYH9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
UTP6Q9NYH9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UTP6Q9NYH9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UTP6Q9NYH9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UTP6Q9NYH9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UTP6Q9NYH9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UTP6Q9NYH9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UTP6Q9NYH9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UTP6Q9NYH9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UTP6Q9NYH9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UTP6Q9NYH9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UTP6Q9NYH9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UTP6Q9NYH9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
UTP6Q9NYH9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
UTP6Q9NYH9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UTP6Q9NYH9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UTP6Q9NYH9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UTP6Q9NYH9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UTP6Q9NYH9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UTP6Q9NYH9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UTP6Q9NYH9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UTP6Q9NYH9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UTP6Q9NYH9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UTP6Q9NYH9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UTP6Q9NYH9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UTP6Q9NYH9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
UTP6Q9NYH9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
UTP6Q9NYH9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
UTP6Q9NYH9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UTP6Q9NYH9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UTP6Q9NYH9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
UTP6Q9NYH9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UTP6Q9NYH9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
UTP6Q9NYH9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
UTP6Q9NYH9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
UTP6Q9NYH9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UTP6Q9NYH9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UTP6Q9NYH9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UTP6Q9NYH9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
UTP6Q9NYH9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
UTP6Q9NYH9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
UTP6Q9NYH9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
UTP6Q9NYH9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UTP6Q9NYH9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UTP6Q9NYH9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UTP6Q9NYH9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
UTP6Q9NYH9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
UTP6Q9NYH9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UTP6Q9NYH9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UTP6Q9NYH9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UTP6Q9NYH9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UTP6Q9NYH9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UTP6Q9NYH9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UTP6Q9NYH9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
UTP6Q9NYH9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UTP6Q9NYH9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
UTP6Q9NYH9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UTP6Q9NYH9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UTP6Q9NYH9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
UTP6Q9NYH9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
UTP6Q9NYH9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UTP6Q9NYH9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UTP6Q9NYH9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
UTP6Q9NYH9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UTP6Q9NYH9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UTP6Q9NYH9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
UTP6Q9NYH9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UTP6Q9NYH9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UTP6Q9NYH9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UTP6Q9NYH9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms