Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYA4

MTMR4, Myotubularin-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR4Q9NYA4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
MTMR4Q9NYA4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
MTMR4Q9NYA4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MTMR4Q9NYA4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MTMR4Q9NYA4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MTMR4Q9NYA4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MTMR4Q9NYA4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
MTMR4Q9NYA4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
MTMR4Q9NYA4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MTMR4Q9NYA4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MTMR4Q9NYA4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MTMR4Q9NYA4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MTMR4Q9NYA4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MTMR4Q9NYA4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
MTMR4Q9NYA4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MTMR4Q9NYA4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MTMR4Q9NYA4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MTMR4Q9NYA4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MTMR4Q9NYA4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MTMR4Q9NYA4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MTMR4Q9NYA4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MTMR4Q9NYA4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MTMR4Q9NYA4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MTMR4Q9NYA4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MTMR4Q9NYA4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MTMR4Q9NYA4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MTMR4Q9NYA4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MTMR4Q9NYA4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MTMR4Q9NYA4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MTMR4Q9NYA4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MTMR4Q9NYA4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MTMR4Q9NYA4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MTMR4Q9NYA4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MTMR4Q9NYA4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
MTMR4Q9NYA4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MTMR4Q9NYA4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MTMR4Q9NYA4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MTMR4Q9NYA4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MTMR4Q9NYA4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MTMR4Q9NYA4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MTMR4Q9NYA4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MTMR4Q9NYA4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MTMR4Q9NYA4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MTMR4Q9NYA4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MTMR4Q9NYA4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
MTMR4Q9NYA4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MTMR4Q9NYA4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MTMR4Q9NYA4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MTMR4Q9NYA4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MTMR4Q9NYA4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MTMR4Q9NYA4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MTMR4Q9NYA4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
MTMR4Q9NYA4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MTMR4Q9NYA4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MTMR4Q9NYA4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MTMR4Q9NYA4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MTMR4Q9NYA4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MTMR4Q9NYA4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MTMR4Q9NYA4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MTMR4Q9NYA4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MTMR4Q9NYA4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MTMR4Q9NYA4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MTMR4Q9NYA4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MTMR4Q9NYA4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MTMR4Q9NYA4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MTMR4Q9NYA4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MTMR4Q9NYA4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MTMR4Q9NYA4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
MTMR4Q9NYA4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MTMR4Q9NYA4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MTMR4Q9NYA4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MTMR4Q9NYA4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MTMR4Q9NYA4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MTMR4Q9NYA4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MTMR4Q9NYA4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MTMR4Q9NYA4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MTMR4Q9NYA4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MTMR4Q9NYA4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MTMR4Q9NYA4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MTMR4Q9NYA4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MTMR4Q9NYA4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MTMR4Q9NYA4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MTMR4Q9NYA4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MTMR4Q9NYA4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MTMR4Q9NYA4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MTMR4Q9NYA4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MTMR4Q9NYA4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MTMR4Q9NYA4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MTMR4Q9NYA4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
MTMR4Q9NYA4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MTMR4Q9NYA4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MTMR4Q9NYA4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MTMR4Q9NYA4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MTMR4Q9NYA4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MTMR4Q9NYA4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
MTMR4Q9NYA4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MTMR4Q9NYA4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MTMR4Q9NYA4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
MTMR4Q9NYA4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
MTMR4Q9NYA4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms