Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY61

AATF, Protein AATF, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AATFQ9NY61 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.872e-7■■■■■ 38.3
AATFQ9NY61 MICALL2-204ENST00000467394 2080 ntTSL 223.16■■□□□ 1.36e-7■■■■■ 38.1
AATFQ9NY61 KDM4B-205ENST00000588337 504 ntTSL 532.88■■■□□ 2.853e-6■■■■■ 38
AATFQ9NY61 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.314e-8■■■■■ 37.8
AATFQ9NY61 LRRC75A-AS1-218ENST00000578380 310 ntTSL 326.37■■□□□ 1.811e-14■■■■■ 37.8
AATFQ9NY61 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.012e-20■■■■■ 37.5
AATFQ9NY61 SNHG12-201ENST00000461448 1629 ntTSL 1 (best)23.56■■□□□ 1.362e-20■■■■■ 37.5
AATFQ9NY61 SNHG12-208ENST00000481220 751 ntTSL 322.25■■□□□ 1.152e-20■■■■■ 37.5
AATFQ9NY61 SNHG12-206ENST00000474814 1903 ntTSL 220.91■□□□□ 0.942e-20■■■■■ 37.5
AATFQ9NY61 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.512e-20■■■■■ 37.5
AATFQ9NY61 SNHG12-209ENST00000481368 1588 ntTSL 1 (best)17.66■□□□□ 0.422e-20■■■■■ 37.5
AATFQ9NY61 SNHG12-205ENST00000470977 1098 ntTSL 1 (best)15.94■□□□□ 0.142e-20■■■■■ 37.5
AATFQ9NY61 SNHG12-204ENST00000464612 719 ntTSL 1 (best)10.9□□□□□ -0.662e-20■■■■■ 37.5
AATFQ9NY61 SNHG12-211ENST00000488745 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.712e-20■■■■■ 37.5
AATFQ9NY61 SNHG12-207ENST00000475441 444 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.242e-20■■■■■ 37.5
AATFQ9NY61 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.6□□□□□ -2.312e-20■■■■■ 37.5
AATFQ9NY61 TLK1-202ENST00000360843 5726 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.013e-6■■■■■ 37.4
AATFQ9NY61 TLK1-205ENST00000431350 5663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.043e-6■■■■■ 37.4
AATFQ9NY61 TLK1-201ENST00000359766 4321 ntTSL 512.69□□□□□ -0.383e-6■■■■■ 37.4
AATFQ9NY61 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.53e-6■■■■■ 37.4
AATFQ9NY61 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.993e-6■■■■■ 37.4
AATFQ9NY61 UBAC2-204ENST00000457666 627 ntTSL 322.16■■□□□ 1.142e-39■■■■■ 37.4
AATFQ9NY61 UBAC2-201ENST00000355700 748 ntTSL 320.84■□□□□ 0.932e-39■■■■■ 37.4
AATFQ9NY61 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.832e-39■■■■■ 37.4
AATFQ9NY61 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.422e-39■■■■■ 37.4
AATFQ9NY61 UBAC2-206ENST00000468067 968 ntTSL 214.31□□□□□ -0.122e-39■■■■■ 37.4
AATFQ9NY61 RN7SKP9-201ENST00000364923 299 ntBASIC14.12□□□□□ -0.152e-39■■■■■ 37.4
AATFQ9NY61 UBAC2-207ENST00000473091 610 ntTSL 413.07□□□□□ -0.322e-39■■■■■ 37.4
AATFQ9NY61 RXRA-201ENST00000356384 5770 ntTSL 517.76■□□□□ 0.436e-6■■■■■ 37.4
AATFQ9NY61 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.665e-7■■■■■ 37.4
AATFQ9NY61 RN7SKP176-201ENST00000363673 318 ntBASIC14.3□□□□□ -0.128e-8■■■■■ 37.2
AATFQ9NY61 PLCG2-207ENST00000564138 8707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.458e-8■■■■■ 37.2
AATFQ9NY61 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.161e-6■■■■■ 37
AATFQ9NY61 NCOR2-215ENST00000458234 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)15.78■□□□□ 0.121e-6■■■■■ 37
AATFQ9NY61 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.121e-6■■■■■ 37
AATFQ9NY61 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.181e-6■■■■■ 37
AATFQ9NY61 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.563e-6■■■■■ 36.8
AATFQ9NY61 GAS8-204ENST00000540721 1308 ntTSL 223.77■■□□□ 1.43e-6■■■■■ 36.8
AATFQ9NY61 GAS8-212ENST00000565062 1394 ntTSL 221.65■■□□□ 1.063e-6■■■■■ 36.8
AATFQ9NY61 GAS8-217ENST00000568705 659 ntTSL 321.31■■□□□ 13e-6■■■■■ 36.8
AATFQ9NY61 GAS8-203ENST00000537797 1080 ntTSL 218.77■□□□□ 0.63e-6■■■■■ 36.8
AATFQ9NY61 GAS8-201ENST00000268699 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.023e-6■■■■■ 36.8
AATFQ9NY61 GAS8-220ENST00000620723 3308 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.23e-6■■■■■ 36.8
AATFQ9NY61 GAS8-214ENST00000566266 3174 ntTSL 1 (best)12.71□□□□□ -0.373e-6■■■■■ 36.8
AATFQ9NY61 GAS8-205ENST00000561675 486 ntTSL 311.65□□□□□ -0.543e-6■■■■■ 36.8
AATFQ9NY61 GAS8-219ENST00000569558 3856 ntTSL 211□□□□□ -0.653e-6■■■■■ 36.8
AATFQ9NY61 GAS8-207ENST00000564392 479 ntTSL 310.29□□□□□ -0.763e-6■■■■■ 36.8
AATFQ9NY61 AGPAT3-208ENST00000448287 454 ntTSL 314.59□□□□□ -0.073e-6■■■■■ 36.6
AATFQ9NY61 PUM1-202ENST00000373741 4242 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.241e-6■■■■■ 36.6
AATFQ9NY61 PUM1-201ENST00000257075 5360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.471e-6■■■■■ 36.6
AATFQ9NY61 PUM1-203ENST00000373742 3515 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.761e-6■■■■■ 36.6
AATFQ9NY61 PUM1-204ENST00000373747 5375 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.911e-6■■■■■ 36.6
AATFQ9NY61 PUM1-205ENST00000424085 4631 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -11e-6■■■■■ 36.6
AATFQ9NY61 PUM1-214ENST00000525843 4528 ntTSL 58.14□□□□□ -1.111e-6■■■■■ 36.6
AATFQ9NY61 PUM1-206ENST00000426105 4043 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.121e-6■■■■■ 36.6
AATFQ9NY61 PUM1-211ENST00000498419 3068 ntTSL 57.82□□□□□ -1.161e-6■■■■■ 36.6
AATFQ9NY61 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.211e-6■■■■■ 36.6
AATFQ9NY61 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.672e-6■■■■■ 36.5
AATFQ9NY61 ZMYND8-202ENST00000311275 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.497e-10■■■■■ 36.5
AATFQ9NY61 ZMYND8-205ENST00000360911 4991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.567e-10■■■■■ 36.5
AATFQ9NY61 ZMYND8-217ENST00000536340 5273 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.577e-10■■■■■ 36.5
AATFQ9NY61 ZMYND8-220ENST00000617418 3411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.67e-10■■■■■ 36.5
AATFQ9NY61 ZMYND8-215ENST00000468376 4064 ntTSL 1 (best)11.19□□□□□ -0.627e-10■■■■■ 36.5
AATFQ9NY61 ZMYND8-214ENST00000467200 3634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)10.89□□□□□ -0.677e-10■■■■■ 36.5
AATFQ9NY61 ZMYND8-213ENST00000461685 3567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.727e-10■■■■■ 36.5
AATFQ9NY61 ZMYND8-204ENST00000355972 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.727e-10■■■■■ 36.5
AATFQ9NY61 ZMYND8-219ENST00000611941 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.817e-10■■■■■ 36.5
AATFQ9NY61 ZMYND8-201ENST00000262975 4139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.837e-10■■■■■ 36.5
AATFQ9NY61 ZMYND8-218ENST00000540497 3405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.837e-10■■■■■ 36.5
AATFQ9NY61 ZMYND8-207ENST00000396281 5511 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.897e-10■■■■■ 36.5
AATFQ9NY61 ZMYND8-212ENST00000458360 3729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.917e-10■■■■■ 36.5
AATFQ9NY61 ZMYND8-203ENST00000352431 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.937e-10■■■■■ 36.5
AATFQ9NY61 ZMYND8-206ENST00000372023 5144 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.967e-10■■■■■ 36.5
AATFQ9NY61 ZMYND8-216ENST00000471951 4053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.997e-10■■■■■ 36.5
AATFQ9NY61 ZMYND8-221ENST00000619049 4027 ntTSL 5 BASIC8.78□□□□□ -17e-10■■■■■ 36.5
AATFQ9NY61 ZMYND8-211ENST00000446994 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.057e-10■■■■■ 36.5
AATFQ9NY61 AGPAT3-207ENST00000445582 582 ntTSL 315.32■□□□□ 0.045e-6■■■■■ 36.5
AATFQ9NY61 ARL6IP6-205ENST00000495469 1308 ntTSL 225.63■■□□□ 1.693e-7■■■■■ 36.5
AATFQ9NY61 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.963e-7■■■■■ 36.5
AATFQ9NY61 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.783e-7■■■■■ 36.5
AATFQ9NY61 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.683e-7■■■■■ 36.5
AATFQ9NY61 DRD4-202ENST00000528733 361 ntTSL 318.88■□□□□ 0.613e-7■■■■■ 36.5
AATFQ9NY61 NDUFB11-201ENST00000276062 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.123e-7■■■■■ 36.5
AATFQ9NY61 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.083e-7■■■■■ 36.5
AATFQ9NY61 ELOVL5-204ENST00000465983 696 ntTSL 315.51■□□□□ 0.075e-6■■■■■ 36.5
AATFQ9NY61 ELOVL5-206ENST00000486973 794 ntTSL 315.41■□□□□ 0.065e-6■■■■■ 36.5
AATFQ9NY61 FLVCR2-205ENST00000554496 441 ntTSL 314.48□□□□□ -0.093e-10■■■■■ 36.5
AATFQ9NY61 ELOVL5-202ENST00000370913 580 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.125e-6■■■■■ 36.5
AATFQ9NY61 FLVCR2-201ENST00000238667 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.233e-10■■■■■ 36.5
AATFQ9NY61 RNF213-201ENST00000319921 5316 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.233e-7■■■■■ 36.5
AATFQ9NY61 FLVCR2-209ENST00000555385 218 ntTSL 412□□□□□ -0.493e-10■■■■■ 36.5
AATFQ9NY61 ELOVL5-205ENST00000485336 761 ntTSL 511.74□□□□□ -0.535e-6■■■■■ 36.5
AATFQ9NY61 ELOVL5-201ENST00000304434 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.965e-6■■■■■ 36.5
AATFQ9NY61 ELOVL5-207ENST00000542638 2875 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.965e-6■■■■■ 36.5
AATFQ9NY61 RN7SKP107-201ENST00000364157 290 ntBASIC8.55□□□□□ -1.043e-10■■■■■ 36.5
AATFQ9NY61 RNF213-220ENST00000582970 21055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.153e-7■■■■■ 36.5
AATFQ9NY61 ELOVL5-203ENST00000370918 3081 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.235e-6■■■■■ 36.5
AATFQ9NY61 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.453e-7■■■■■ 36.5
AATFQ9NY61 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.643e-7■■■■■ 36.5
AATFQ9NY61 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC4.38□□□□□ -1.713e-10■■■■■ 36.5
Retrieved 100 of 5,565 protein–RNA pairs in 65.5 ms