Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXL2

ARHGEF38, Rho guanine nucleotide exchange factor 38, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF38Q9NXL2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARHGEF38Q9NXL2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARHGEF38Q9NXL2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARHGEF38Q9NXL2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARHGEF38Q9NXL2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARHGEF38Q9NXL2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARHGEF38Q9NXL2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARHGEF38Q9NXL2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARHGEF38Q9NXL2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARHGEF38Q9NXL2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARHGEF38Q9NXL2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARHGEF38Q9NXL2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARHGEF38Q9NXL2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARHGEF38Q9NXL2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARHGEF38Q9NXL2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ARHGEF38Q9NXL2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARHGEF38Q9NXL2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARHGEF38Q9NXL2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARHGEF38Q9NXL2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARHGEF38Q9NXL2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARHGEF38Q9NXL2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ARHGEF38Q9NXL2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ARHGEF38Q9NXL2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ARHGEF38Q9NXL2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARHGEF38Q9NXL2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARHGEF38Q9NXL2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ARHGEF38Q9NXL2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARHGEF38Q9NXL2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARHGEF38Q9NXL2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARHGEF38Q9NXL2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARHGEF38Q9NXL2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARHGEF38Q9NXL2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARHGEF38Q9NXL2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARHGEF38Q9NXL2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARHGEF38Q9NXL2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARHGEF38Q9NXL2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARHGEF38Q9NXL2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARHGEF38Q9NXL2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARHGEF38Q9NXL2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARHGEF38Q9NXL2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARHGEF38Q9NXL2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARHGEF38Q9NXL2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARHGEF38Q9NXL2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARHGEF38Q9NXL2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARHGEF38Q9NXL2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARHGEF38Q9NXL2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARHGEF38Q9NXL2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARHGEF38Q9NXL2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARHGEF38Q9NXL2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARHGEF38Q9NXL2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARHGEF38Q9NXL2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARHGEF38Q9NXL2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ARHGEF38Q9NXL2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ARHGEF38Q9NXL2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ARHGEF38Q9NXL2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ARHGEF38Q9NXL2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARHGEF38Q9NXL2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARHGEF38Q9NXL2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARHGEF38Q9NXL2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARHGEF38Q9NXL2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARHGEF38Q9NXL2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARHGEF38Q9NXL2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARHGEF38Q9NXL2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARHGEF38Q9NXL2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARHGEF38Q9NXL2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARHGEF38Q9NXL2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARHGEF38Q9NXL2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ARHGEF38Q9NXL2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGEF38Q9NXL2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGEF38Q9NXL2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGEF38Q9NXL2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGEF38Q9NXL2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGEF38Q9NXL2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGEF38Q9NXL2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGEF38Q9NXL2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGEF38Q9NXL2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARHGEF38Q9NXL2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARHGEF38Q9NXL2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARHGEF38Q9NXL2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARHGEF38Q9NXL2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARHGEF38Q9NXL2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARHGEF38Q9NXL2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARHGEF38Q9NXL2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ARHGEF38Q9NXL2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARHGEF38Q9NXL2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARHGEF38Q9NXL2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARHGEF38Q9NXL2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARHGEF38Q9NXL2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARHGEF38Q9NXL2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ARHGEF38Q9NXL2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARHGEF38Q9NXL2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARHGEF38Q9NXL2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARHGEF38Q9NXL2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARHGEF38Q9NXL2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ARHGEF38Q9NXL2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARHGEF38Q9NXL2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARHGEF38Q9NXL2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARHGEF38Q9NXL2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ARHGEF38Q9NXL2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARHGEF38Q9NXL2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms