Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXB0

MKS1, Meckel syndrome type 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKS1Q9NXB0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MKS1Q9NXB0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MKS1Q9NXB0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MKS1Q9NXB0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
MKS1Q9NXB0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MKS1Q9NXB0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MKS1Q9NXB0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MKS1Q9NXB0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MKS1Q9NXB0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MKS1Q9NXB0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MKS1Q9NXB0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MKS1Q9NXB0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MKS1Q9NXB0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MKS1Q9NXB0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MKS1Q9NXB0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MKS1Q9NXB0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MKS1Q9NXB0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MKS1Q9NXB0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MKS1Q9NXB0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MKS1Q9NXB0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MKS1Q9NXB0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MKS1Q9NXB0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MKS1Q9NXB0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MKS1Q9NXB0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MKS1Q9NXB0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MKS1Q9NXB0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
MKS1Q9NXB0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MKS1Q9NXB0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MKS1Q9NXB0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MKS1Q9NXB0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MKS1Q9NXB0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MKS1Q9NXB0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MKS1Q9NXB0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MKS1Q9NXB0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MKS1Q9NXB0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MKS1Q9NXB0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MKS1Q9NXB0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MKS1Q9NXB0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MKS1Q9NXB0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MKS1Q9NXB0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MKS1Q9NXB0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MKS1Q9NXB0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MKS1Q9NXB0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MKS1Q9NXB0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MKS1Q9NXB0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MKS1Q9NXB0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
MKS1Q9NXB0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MKS1Q9NXB0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MKS1Q9NXB0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MKS1Q9NXB0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MKS1Q9NXB0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MKS1Q9NXB0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MKS1Q9NXB0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MKS1Q9NXB0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MKS1Q9NXB0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MKS1Q9NXB0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MKS1Q9NXB0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MKS1Q9NXB0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MKS1Q9NXB0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MKS1Q9NXB0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MKS1Q9NXB0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MKS1Q9NXB0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MKS1Q9NXB0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MKS1Q9NXB0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MKS1Q9NXB0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MKS1Q9NXB0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MKS1Q9NXB0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MKS1Q9NXB0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MKS1Q9NXB0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MKS1Q9NXB0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MKS1Q9NXB0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MKS1Q9NXB0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MKS1Q9NXB0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MKS1Q9NXB0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MKS1Q9NXB0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MKS1Q9NXB0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MKS1Q9NXB0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MKS1Q9NXB0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MKS1Q9NXB0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
MKS1Q9NXB0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MKS1Q9NXB0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MKS1Q9NXB0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MKS1Q9NXB0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MKS1Q9NXB0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MKS1Q9NXB0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MKS1Q9NXB0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
MKS1Q9NXB0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MKS1Q9NXB0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MKS1Q9NXB0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MKS1Q9NXB0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MKS1Q9NXB0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MKS1Q9NXB0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MKS1Q9NXB0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MKS1Q9NXB0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MKS1Q9NXB0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MKS1Q9NXB0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MKS1Q9NXB0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MKS1Q9NXB0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MKS1Q9NXB0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MKS1Q9NXB0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms