Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW38

FANCL, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCLQ9NW38 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FANCLQ9NW38 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FANCLQ9NW38 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FANCLQ9NW38 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FANCLQ9NW38 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FANCLQ9NW38 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FANCLQ9NW38 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FANCLQ9NW38 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FANCLQ9NW38 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FANCLQ9NW38 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FANCLQ9NW38 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FANCLQ9NW38 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FANCLQ9NW38 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FANCLQ9NW38 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FANCLQ9NW38 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FANCLQ9NW38 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FANCLQ9NW38 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FANCLQ9NW38 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FANCLQ9NW38 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
FANCLQ9NW38 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
FANCLQ9NW38 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FANCLQ9NW38 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FANCLQ9NW38 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FANCLQ9NW38 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FANCLQ9NW38 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
FANCLQ9NW38 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FANCLQ9NW38 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FANCLQ9NW38 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FANCLQ9NW38 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FANCLQ9NW38 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FANCLQ9NW38 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FANCLQ9NW38 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FANCLQ9NW38 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FANCLQ9NW38 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FANCLQ9NW38 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FANCLQ9NW38 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
FANCLQ9NW38 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FANCLQ9NW38 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FANCLQ9NW38 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FANCLQ9NW38 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FANCLQ9NW38 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FANCLQ9NW38 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FANCLQ9NW38 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FANCLQ9NW38 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FANCLQ9NW38 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FANCLQ9NW38 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FANCLQ9NW38 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FANCLQ9NW38 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FANCLQ9NW38 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FANCLQ9NW38 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FANCLQ9NW38 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FANCLQ9NW38 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FANCLQ9NW38 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FANCLQ9NW38 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FANCLQ9NW38 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FANCLQ9NW38 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FANCLQ9NW38 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FANCLQ9NW38 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FANCLQ9NW38 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FANCLQ9NW38 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FANCLQ9NW38 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FANCLQ9NW38 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
FANCLQ9NW38 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
FANCLQ9NW38 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FANCLQ9NW38 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FANCLQ9NW38 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FANCLQ9NW38 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FANCLQ9NW38 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FANCLQ9NW38 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FANCLQ9NW38 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FANCLQ9NW38 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FANCLQ9NW38 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FANCLQ9NW38 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FANCLQ9NW38 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FANCLQ9NW38 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FANCLQ9NW38 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FANCLQ9NW38 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
FANCLQ9NW38 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FANCLQ9NW38 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FANCLQ9NW38 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FANCLQ9NW38 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FANCLQ9NW38 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FANCLQ9NW38 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FANCLQ9NW38 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FANCLQ9NW38 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FANCLQ9NW38 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FANCLQ9NW38 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FANCLQ9NW38 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FANCLQ9NW38 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FANCLQ9NW38 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FANCLQ9NW38 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FANCLQ9NW38 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FANCLQ9NW38 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FANCLQ9NW38 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FANCLQ9NW38 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FANCLQ9NW38 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FANCLQ9NW38 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FANCLQ9NW38 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FANCLQ9NW38 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FANCLQ9NW38 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms