Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVS2

MRPS18A, 39S ribosomal protein S18a, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS18AQ9NVS2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRPS18AQ9NVS2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MRPS18AQ9NVS2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MRPS18AQ9NVS2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
MRPS18AQ9NVS2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MRPS18AQ9NVS2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MRPS18AQ9NVS2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MRPS18AQ9NVS2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRPS18AQ9NVS2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRPS18AQ9NVS2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRPS18AQ9NVS2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRPS18AQ9NVS2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
MRPS18AQ9NVS2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRPS18AQ9NVS2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRPS18AQ9NVS2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRPS18AQ9NVS2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRPS18AQ9NVS2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRPS18AQ9NVS2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRPS18AQ9NVS2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MRPS18AQ9NVS2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MRPS18AQ9NVS2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MRPS18AQ9NVS2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MRPS18AQ9NVS2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MRPS18AQ9NVS2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MRPS18AQ9NVS2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MRPS18AQ9NVS2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MRPS18AQ9NVS2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MRPS18AQ9NVS2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRPS18AQ9NVS2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRPS18AQ9NVS2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRPS18AQ9NVS2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRPS18AQ9NVS2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRPS18AQ9NVS2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRPS18AQ9NVS2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRPS18AQ9NVS2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRPS18AQ9NVS2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MRPS18AQ9NVS2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MRPS18AQ9NVS2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MRPS18AQ9NVS2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MRPS18AQ9NVS2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MRPS18AQ9NVS2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MRPS18AQ9NVS2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MRPS18AQ9NVS2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
MRPS18AQ9NVS2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
MRPS18AQ9NVS2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MRPS18AQ9NVS2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MRPS18AQ9NVS2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MRPS18AQ9NVS2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MRPS18AQ9NVS2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MRPS18AQ9NVS2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MRPS18AQ9NVS2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MRPS18AQ9NVS2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MRPS18AQ9NVS2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MRPS18AQ9NVS2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MRPS18AQ9NVS2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MRPS18AQ9NVS2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MRPS18AQ9NVS2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
MRPS18AQ9NVS2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MRPS18AQ9NVS2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MRPS18AQ9NVS2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MRPS18AQ9NVS2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MRPS18AQ9NVS2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MRPS18AQ9NVS2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MRPS18AQ9NVS2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MRPS18AQ9NVS2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MRPS18AQ9NVS2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MRPS18AQ9NVS2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MRPS18AQ9NVS2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MRPS18AQ9NVS2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRPS18AQ9NVS2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRPS18AQ9NVS2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRPS18AQ9NVS2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRPS18AQ9NVS2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRPS18AQ9NVS2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRPS18AQ9NVS2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRPS18AQ9NVS2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRPS18AQ9NVS2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MRPS18AQ9NVS2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRPS18AQ9NVS2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRPS18AQ9NVS2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRPS18AQ9NVS2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MRPS18AQ9NVS2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRPS18AQ9NVS2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRPS18AQ9NVS2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRPS18AQ9NVS2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRPS18AQ9NVS2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRPS18AQ9NVS2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRPS18AQ9NVS2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MRPS18AQ9NVS2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRPS18AQ9NVS2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRPS18AQ9NVS2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRPS18AQ9NVS2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MRPS18AQ9NVS2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRPS18AQ9NVS2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRPS18AQ9NVS2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRPS18AQ9NVS2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRPS18AQ9NVS2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRPS18AQ9NVS2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRPS18AQ9NVS2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRPS18AQ9NVS2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.5 ms