Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TBCCD1Q9NVR7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TBCCD1Q9NVR7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TBCCD1Q9NVR7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TBCCD1Q9NVR7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TBCCD1Q9NVR7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TBCCD1Q9NVR7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TBCCD1Q9NVR7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TBCCD1Q9NVR7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TBCCD1Q9NVR7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TBCCD1Q9NVR7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TBCCD1Q9NVR7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TBCCD1Q9NVR7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TBCCD1Q9NVR7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TBCCD1Q9NVR7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TBCCD1Q9NVR7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TBCCD1Q9NVR7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TBCCD1Q9NVR7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TBCCD1Q9NVR7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TBCCD1Q9NVR7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TBCCD1Q9NVR7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TBCCD1Q9NVR7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TBCCD1Q9NVR7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TBCCD1Q9NVR7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TBCCD1Q9NVR7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TBCCD1Q9NVR7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TBCCD1Q9NVR7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TBCCD1Q9NVR7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TBCCD1Q9NVR7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TBCCD1Q9NVR7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TBCCD1Q9NVR7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TBCCD1Q9NVR7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TBCCD1Q9NVR7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TBCCD1Q9NVR7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TBCCD1Q9NVR7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TBCCD1Q9NVR7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TBCCD1Q9NVR7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TBCCD1Q9NVR7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TBCCD1Q9NVR7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TBCCD1Q9NVR7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TBCCD1Q9NVR7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TBCCD1Q9NVR7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TBCCD1Q9NVR7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TBCCD1Q9NVR7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TBCCD1Q9NVR7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TBCCD1Q9NVR7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TBCCD1Q9NVR7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TBCCD1Q9NVR7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TBCCD1Q9NVR7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TBCCD1Q9NVR7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TBCCD1Q9NVR7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TBCCD1Q9NVR7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TBCCD1Q9NVR7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TBCCD1Q9NVR7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TBCCD1Q9NVR7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TBCCD1Q9NVR7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TBCCD1Q9NVR7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TBCCD1Q9NVR7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TBCCD1Q9NVR7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TBCCD1Q9NVR7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TBCCD1Q9NVR7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TBCCD1Q9NVR7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TBCCD1Q9NVR7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.11
TBCCD1Q9NVR7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TBCCD1Q9NVR7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TBCCD1Q9NVR7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TBCCD1Q9NVR7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TBCCD1Q9NVR7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TBCCD1Q9NVR7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TBCCD1Q9NVR7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TBCCD1Q9NVR7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TBCCD1Q9NVR7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TBCCD1Q9NVR7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TBCCD1Q9NVR7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TBCCD1Q9NVR7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TBCCD1Q9NVR7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TBCCD1Q9NVR7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TBCCD1Q9NVR7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TBCCD1Q9NVR7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TBCCD1Q9NVR7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TBCCD1Q9NVR7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TBCCD1Q9NVR7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TBCCD1Q9NVR7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TBCCD1Q9NVR7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TBCCD1Q9NVR7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TBCCD1Q9NVR7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TBCCD1Q9NVR7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TBCCD1Q9NVR7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TBCCD1Q9NVR7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TBCCD1Q9NVR7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TBCCD1Q9NVR7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TBCCD1Q9NVR7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TBCCD1Q9NVR7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TBCCD1Q9NVR7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TBCCD1Q9NVR7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TBCCD1Q9NVR7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TBCCD1Q9NVR7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TBCCD1Q9NVR7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TBCCD1Q9NVR7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TBCCD1Q9NVR7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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