Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS64

RPRM, Protein reprimo, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRMQ9NS64 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPRMQ9NS64 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPRMQ9NS64 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPRMQ9NS64 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPRMQ9NS64 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPRMQ9NS64 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPRMQ9NS64 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPRMQ9NS64 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPRMQ9NS64 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
RPRMQ9NS64 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPRMQ9NS64 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPRMQ9NS64 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPRMQ9NS64 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPRMQ9NS64 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPRMQ9NS64 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPRMQ9NS64 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPRMQ9NS64 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPRMQ9NS64 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPRMQ9NS64 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPRMQ9NS64 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPRMQ9NS64 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPRMQ9NS64 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPRMQ9NS64 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPRMQ9NS64 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPRMQ9NS64 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
RPRMQ9NS64 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPRMQ9NS64 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPRMQ9NS64 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPRMQ9NS64 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPRMQ9NS64 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPRMQ9NS64 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPRMQ9NS64 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPRMQ9NS64 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPRMQ9NS64 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPRMQ9NS64 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
RPRMQ9NS64 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPRMQ9NS64 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
RPRMQ9NS64 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPRMQ9NS64 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPRMQ9NS64 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RPRMQ9NS64 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPRMQ9NS64 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RPRMQ9NS64 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
RPRMQ9NS64 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPRMQ9NS64 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPRMQ9NS64 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPRMQ9NS64 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RPRMQ9NS64 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPRMQ9NS64 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPRMQ9NS64 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPRMQ9NS64 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPRMQ9NS64 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPRMQ9NS64 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPRMQ9NS64 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPRMQ9NS64 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPRMQ9NS64 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPRMQ9NS64 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPRMQ9NS64 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPRMQ9NS64 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPRMQ9NS64 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPRMQ9NS64 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPRMQ9NS64 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPRMQ9NS64 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPRMQ9NS64 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPRMQ9NS64 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPRMQ9NS64 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPRMQ9NS64 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPRMQ9NS64 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPRMQ9NS64 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPRMQ9NS64 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPRMQ9NS64 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPRMQ9NS64 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPRMQ9NS64 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPRMQ9NS64 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPRMQ9NS64 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPRMQ9NS64 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPRMQ9NS64 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RPRMQ9NS64 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPRMQ9NS64 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPRMQ9NS64 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPRMQ9NS64 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPRMQ9NS64 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPRMQ9NS64 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPRMQ9NS64 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPRMQ9NS64 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPRMQ9NS64 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPRMQ9NS64 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPRMQ9NS64 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPRMQ9NS64 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPRMQ9NS64 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPRMQ9NS64 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPRMQ9NS64 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPRMQ9NS64 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPRMQ9NS64 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPRMQ9NS64 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPRMQ9NS64 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPRMQ9NS64 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPRMQ9NS64 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPRMQ9NS64 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPRMQ9NS64 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms