Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRZ9

HELLS, Lymphoid-specific helicase, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELLSQ9NRZ9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
HELLSQ9NRZ9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
HELLSQ9NRZ9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
HELLSQ9NRZ9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
HELLSQ9NRZ9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
HELLSQ9NRZ9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HELLSQ9NRZ9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HELLSQ9NRZ9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HELLSQ9NRZ9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
HELLSQ9NRZ9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HELLSQ9NRZ9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HELLSQ9NRZ9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HELLSQ9NRZ9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
HELLSQ9NRZ9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
HELLSQ9NRZ9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HELLSQ9NRZ9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
HELLSQ9NRZ9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HELLSQ9NRZ9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HELLSQ9NRZ9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
HELLSQ9NRZ9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HELLSQ9NRZ9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HELLSQ9NRZ9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
HELLSQ9NRZ9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
HELLSQ9NRZ9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HELLSQ9NRZ9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HELLSQ9NRZ9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HELLSQ9NRZ9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HELLSQ9NRZ9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
HELLSQ9NRZ9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HELLSQ9NRZ9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HELLSQ9NRZ9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HELLSQ9NRZ9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
HELLSQ9NRZ9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HELLSQ9NRZ9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
HELLSQ9NRZ9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
HELLSQ9NRZ9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HELLSQ9NRZ9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HELLSQ9NRZ9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HELLSQ9NRZ9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HELLSQ9NRZ9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HELLSQ9NRZ9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HELLSQ9NRZ9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
HELLSQ9NRZ9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
HELLSQ9NRZ9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HELLSQ9NRZ9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
HELLSQ9NRZ9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
HELLSQ9NRZ9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
HELLSQ9NRZ9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
HELLSQ9NRZ9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
HELLSQ9NRZ9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
HELLSQ9NRZ9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
HELLSQ9NRZ9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HELLSQ9NRZ9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HELLSQ9NRZ9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HELLSQ9NRZ9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HELLSQ9NRZ9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
HELLSQ9NRZ9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
HELLSQ9NRZ9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
HELLSQ9NRZ9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
HELLSQ9NRZ9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HELLSQ9NRZ9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
HELLSQ9NRZ9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
HELLSQ9NRZ9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
HELLSQ9NRZ9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
HELLSQ9NRZ9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
HELLSQ9NRZ9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
HELLSQ9NRZ9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HELLSQ9NRZ9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
HELLSQ9NRZ9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HELLSQ9NRZ9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
HELLSQ9NRZ9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HELLSQ9NRZ9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
HELLSQ9NRZ9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
HELLSQ9NRZ9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HELLSQ9NRZ9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HELLSQ9NRZ9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
HELLSQ9NRZ9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
HELLSQ9NRZ9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
HELLSQ9NRZ9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HELLSQ9NRZ9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HELLSQ9NRZ9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HELLSQ9NRZ9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HELLSQ9NRZ9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HELLSQ9NRZ9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HELLSQ9NRZ9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HELLSQ9NRZ9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HELLSQ9NRZ9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HELLSQ9NRZ9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HELLSQ9NRZ9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HELLSQ9NRZ9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HELLSQ9NRZ9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HELLSQ9NRZ9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
HELLSQ9NRZ9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
HELLSQ9NRZ9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
HELLSQ9NRZ9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
HELLSQ9NRZ9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
HELLSQ9NRZ9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
HELLSQ9NRZ9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
HELLSQ9NRZ9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
HELLSQ9NRZ9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms