Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR3

CDC42SE2, CDC42 small effector protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42SE2Q9NRR3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC42SE2Q9NRR3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC42SE2Q9NRR3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC42SE2Q9NRR3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC42SE2Q9NRR3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC42SE2Q9NRR3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC42SE2Q9NRR3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC42SE2Q9NRR3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC42SE2Q9NRR3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC42SE2Q9NRR3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC42SE2Q9NRR3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC42SE2Q9NRR3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC42SE2Q9NRR3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC42SE2Q9NRR3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC42SE2Q9NRR3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC42SE2Q9NRR3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC42SE2Q9NRR3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC42SE2Q9NRR3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC42SE2Q9NRR3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC42SE2Q9NRR3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC42SE2Q9NRR3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC42SE2Q9NRR3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC42SE2Q9NRR3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC42SE2Q9NRR3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC42SE2Q9NRR3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC42SE2Q9NRR3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC42SE2Q9NRR3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC42SE2Q9NRR3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC42SE2Q9NRR3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC42SE2Q9NRR3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC42SE2Q9NRR3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC42SE2Q9NRR3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC42SE2Q9NRR3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC42SE2Q9NRR3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC42SE2Q9NRR3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC42SE2Q9NRR3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDC42SE2Q9NRR3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDC42SE2Q9NRR3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDC42SE2Q9NRR3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDC42SE2Q9NRR3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDC42SE2Q9NRR3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDC42SE2Q9NRR3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDC42SE2Q9NRR3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDC42SE2Q9NRR3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDC42SE2Q9NRR3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDC42SE2Q9NRR3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDC42SE2Q9NRR3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDC42SE2Q9NRR3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDC42SE2Q9NRR3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDC42SE2Q9NRR3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDC42SE2Q9NRR3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDC42SE2Q9NRR3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDC42SE2Q9NRR3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CDC42SE2Q9NRR3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CDC42SE2Q9NRR3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CDC42SE2Q9NRR3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDC42SE2Q9NRR3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDC42SE2Q9NRR3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC42SE2Q9NRR3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC42SE2Q9NRR3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC42SE2Q9NRR3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC42SE2Q9NRR3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC42SE2Q9NRR3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC42SE2Q9NRR3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC42SE2Q9NRR3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC42SE2Q9NRR3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC42SE2Q9NRR3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC42SE2Q9NRR3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC42SE2Q9NRR3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC42SE2Q9NRR3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC42SE2Q9NRR3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC42SE2Q9NRR3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC42SE2Q9NRR3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC42SE2Q9NRR3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC42SE2Q9NRR3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC42SE2Q9NRR3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CDC42SE2Q9NRR3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDC42SE2Q9NRR3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDC42SE2Q9NRR3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDC42SE2Q9NRR3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDC42SE2Q9NRR3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDC42SE2Q9NRR3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDC42SE2Q9NRR3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDC42SE2Q9NRR3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDC42SE2Q9NRR3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDC42SE2Q9NRR3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDC42SE2Q9NRR3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDC42SE2Q9NRR3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDC42SE2Q9NRR3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDC42SE2Q9NRR3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDC42SE2Q9NRR3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDC42SE2Q9NRR3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDC42SE2Q9NRR3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDC42SE2Q9NRR3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDC42SE2Q9NRR3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CDC42SE2Q9NRR3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDC42SE2Q9NRR3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDC42SE2Q9NRR3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDC42SE2Q9NRR3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDC42SE2Q9NRR3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms