Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ3

CCL28, C-C motif chemokine 28, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL28Q9NRJ3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCL28Q9NRJ3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCL28Q9NRJ3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCL28Q9NRJ3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCL28Q9NRJ3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCL28Q9NRJ3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCL28Q9NRJ3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCL28Q9NRJ3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCL28Q9NRJ3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCL28Q9NRJ3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CCL28Q9NRJ3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCL28Q9NRJ3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCL28Q9NRJ3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCL28Q9NRJ3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCL28Q9NRJ3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCL28Q9NRJ3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCL28Q9NRJ3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCL28Q9NRJ3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CCL28Q9NRJ3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCL28Q9NRJ3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCL28Q9NRJ3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCL28Q9NRJ3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCL28Q9NRJ3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCL28Q9NRJ3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCL28Q9NRJ3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCL28Q9NRJ3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCL28Q9NRJ3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCL28Q9NRJ3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CCL28Q9NRJ3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCL28Q9NRJ3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCL28Q9NRJ3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCL28Q9NRJ3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCL28Q9NRJ3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCL28Q9NRJ3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCL28Q9NRJ3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCL28Q9NRJ3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCL28Q9NRJ3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCL28Q9NRJ3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCL28Q9NRJ3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCL28Q9NRJ3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCL28Q9NRJ3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCL28Q9NRJ3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCL28Q9NRJ3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCL28Q9NRJ3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCL28Q9NRJ3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCL28Q9NRJ3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCL28Q9NRJ3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCL28Q9NRJ3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CCL28Q9NRJ3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CCL28Q9NRJ3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CCL28Q9NRJ3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CCL28Q9NRJ3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCL28Q9NRJ3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCL28Q9NRJ3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCL28Q9NRJ3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CCL28Q9NRJ3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CCL28Q9NRJ3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCL28Q9NRJ3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCL28Q9NRJ3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCL28Q9NRJ3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCL28Q9NRJ3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCL28Q9NRJ3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCL28Q9NRJ3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCL28Q9NRJ3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCL28Q9NRJ3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCL28Q9NRJ3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCL28Q9NRJ3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCL28Q9NRJ3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCL28Q9NRJ3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CCL28Q9NRJ3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCL28Q9NRJ3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCL28Q9NRJ3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCL28Q9NRJ3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCL28Q9NRJ3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCL28Q9NRJ3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCL28Q9NRJ3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCL28Q9NRJ3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCL28Q9NRJ3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCL28Q9NRJ3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCL28Q9NRJ3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCL28Q9NRJ3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCL28Q9NRJ3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCL28Q9NRJ3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCL28Q9NRJ3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCL28Q9NRJ3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCL28Q9NRJ3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCL28Q9NRJ3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCL28Q9NRJ3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCL28Q9NRJ3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCL28Q9NRJ3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCL28Q9NRJ3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCL28Q9NRJ3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCL28Q9NRJ3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCL28Q9NRJ3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCL28Q9NRJ3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCL28Q9NRJ3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCL28Q9NRJ3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCL28Q9NRJ3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCL28Q9NRJ3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCL28Q9NRJ3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms