Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR00

C8orf4, Protein C8orf4, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf4Q9NR00 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C8orf4Q9NR00 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C8orf4Q9NR00 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C8orf4Q9NR00 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C8orf4Q9NR00 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C8orf4Q9NR00 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C8orf4Q9NR00 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C8orf4Q9NR00 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C8orf4Q9NR00 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C8orf4Q9NR00 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C8orf4Q9NR00 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C8orf4Q9NR00 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C8orf4Q9NR00 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C8orf4Q9NR00 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C8orf4Q9NR00 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C8orf4Q9NR00 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C8orf4Q9NR00 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C8orf4Q9NR00 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C8orf4Q9NR00 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C8orf4Q9NR00 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C8orf4Q9NR00 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C8orf4Q9NR00 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
C8orf4Q9NR00 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
C8orf4Q9NR00 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C8orf4Q9NR00 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C8orf4Q9NR00 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C8orf4Q9NR00 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C8orf4Q9NR00 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C8orf4Q9NR00 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C8orf4Q9NR00 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C8orf4Q9NR00 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C8orf4Q9NR00 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
C8orf4Q9NR00 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
C8orf4Q9NR00 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C8orf4Q9NR00 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C8orf4Q9NR00 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C8orf4Q9NR00 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C8orf4Q9NR00 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C8orf4Q9NR00 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C8orf4Q9NR00 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C8orf4Q9NR00 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C8orf4Q9NR00 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C8orf4Q9NR00 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C8orf4Q9NR00 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C8orf4Q9NR00 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C8orf4Q9NR00 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C8orf4Q9NR00 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C8orf4Q9NR00 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C8orf4Q9NR00 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C8orf4Q9NR00 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C8orf4Q9NR00 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
C8orf4Q9NR00 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C8orf4Q9NR00 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C8orf4Q9NR00 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C8orf4Q9NR00 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C8orf4Q9NR00 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C8orf4Q9NR00 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C8orf4Q9NR00 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C8orf4Q9NR00 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C8orf4Q9NR00 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C8orf4Q9NR00 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C8orf4Q9NR00 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
C8orf4Q9NR00 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C8orf4Q9NR00 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C8orf4Q9NR00 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C8orf4Q9NR00 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C8orf4Q9NR00 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
C8orf4Q9NR00 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C8orf4Q9NR00 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C8orf4Q9NR00 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C8orf4Q9NR00 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C8orf4Q9NR00 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C8orf4Q9NR00 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C8orf4Q9NR00 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C8orf4Q9NR00 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C8orf4Q9NR00 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C8orf4Q9NR00 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C8orf4Q9NR00 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C8orf4Q9NR00 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C8orf4Q9NR00 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C8orf4Q9NR00 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C8orf4Q9NR00 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C8orf4Q9NR00 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C8orf4Q9NR00 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C8orf4Q9NR00 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C8orf4Q9NR00 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C8orf4Q9NR00 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C8orf4Q9NR00 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C8orf4Q9NR00 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
C8orf4Q9NR00 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C8orf4Q9NR00 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C8orf4Q9NR00 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C8orf4Q9NR00 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C8orf4Q9NR00 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C8orf4Q9NR00 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C8orf4Q9NR00 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C8orf4Q9NR00 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C8orf4Q9NR00 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C8orf4Q9NR00 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C8orf4Q9NR00 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms