Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCC0

MCCC2, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCC2Q9HCC0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCCC2Q9HCC0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
MCCC2Q9HCC0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCCC2Q9HCC0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCCC2Q9HCC0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MCCC2Q9HCC0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MCCC2Q9HCC0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCCC2Q9HCC0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCCC2Q9HCC0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCCC2Q9HCC0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCCC2Q9HCC0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCCC2Q9HCC0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCCC2Q9HCC0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCCC2Q9HCC0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCCC2Q9HCC0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCCC2Q9HCC0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCCC2Q9HCC0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCCC2Q9HCC0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCCC2Q9HCC0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCCC2Q9HCC0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCCC2Q9HCC0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCCC2Q9HCC0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCCC2Q9HCC0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCCC2Q9HCC0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCCC2Q9HCC0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCCC2Q9HCC0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCCC2Q9HCC0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCCC2Q9HCC0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCCC2Q9HCC0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCCC2Q9HCC0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCCC2Q9HCC0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCCC2Q9HCC0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCCC2Q9HCC0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCCC2Q9HCC0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCCC2Q9HCC0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCCC2Q9HCC0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCCC2Q9HCC0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCCC2Q9HCC0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCCC2Q9HCC0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCCC2Q9HCC0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCCC2Q9HCC0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCCC2Q9HCC0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCCC2Q9HCC0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCCC2Q9HCC0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCCC2Q9HCC0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCCC2Q9HCC0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCCC2Q9HCC0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCCC2Q9HCC0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCCC2Q9HCC0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCCC2Q9HCC0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCCC2Q9HCC0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MCCC2Q9HCC0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCCC2Q9HCC0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCCC2Q9HCC0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCCC2Q9HCC0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCCC2Q9HCC0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MCCC2Q9HCC0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MCCC2Q9HCC0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCCC2Q9HCC0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCCC2Q9HCC0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCCC2Q9HCC0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCCC2Q9HCC0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MCCC2Q9HCC0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MCCC2Q9HCC0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCCC2Q9HCC0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCCC2Q9HCC0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCCC2Q9HCC0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCCC2Q9HCC0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MCCC2Q9HCC0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCCC2Q9HCC0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCCC2Q9HCC0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCCC2Q9HCC0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCCC2Q9HCC0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCCC2Q9HCC0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCCC2Q9HCC0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCCC2Q9HCC0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCCC2Q9HCC0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MCCC2Q9HCC0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCCC2Q9HCC0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCCC2Q9HCC0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCCC2Q9HCC0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCCC2Q9HCC0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCCC2Q9HCC0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCCC2Q9HCC0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCCC2Q9HCC0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCCC2Q9HCC0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCCC2Q9HCC0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCCC2Q9HCC0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCCC2Q9HCC0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCCC2Q9HCC0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCCC2Q9HCC0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCCC2Q9HCC0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCCC2Q9HCC0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCCC2Q9HCC0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCCC2Q9HCC0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCCC2Q9HCC0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCCC2Q9HCC0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCCC2Q9HCC0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCCC2Q9HCC0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCCC2Q9HCC0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms